RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 KLC3Q6P597 504 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM171BQ6P995 826 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SNX31Q8N9S9 440 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 HEATR9A2RTY3 570 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 MSI1O43347 362 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 RBP1P09455 135 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 WNT3AP56704 352 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ARTNQ5T4W7 220 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 MANEALQ5VSG8 457 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 UBXN10Q96LJ8 280 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TMLHEQ9NVH6 421 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ASLP04424 464 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CCR1P32246 355 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SCNN1GP51170 649 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 UPP1Q16831 310 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 BRMS1LQ5PSV4 323 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 DDI1Q8WTU0 396 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD49Q8WVL7 239 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SLCO4A1Q96BD0 722 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 MPP6Q9NZW5 540 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAF6Q9Y4K3 522 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ACAP2Q15057 778 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF597Q96LX8 424 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ACBD6Q9BR61 282 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CD300AQ9UGN4 299 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SNX13Q9Y5W8 968 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 H0YJX3 145 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 EPHX2P34913 555 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 IKBKEQ14164 716 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 LAYNQ6UX15 382 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CYP2R1Q6VVX0 501 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SCML4Q8N228 414 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CALML6Q8TD86 181 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TBC1D13Q9NVG8 400 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 DMTF1Q9Y222 760 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 YWHAQP27348 245 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PGFP49763 221 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 NR1H2P55055 460 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM219BQ5XKK7 198 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 AMIGO2Q86SJ2 522 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 HERC6Q8IVU3 1022 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 OR9I1Q8NGQ6 314 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC25A23Q9BV35 468 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM62Q9BVG3 475 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 NRP2O60462 931 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP6AP2O75787 350 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 MT-CO1P00395 513 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CPT1AP50416 773 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 INHBCP55103 352 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC6AQ6EIG7 209 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 BEND5Q7L4P6 421 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRTM3Q86VH5 581 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ABCC13Q9NSE7 274 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 VWA7Q9Y334 891 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF11Q9Y3C5 154 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CEP350Q5VT06 3117 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 HTR7P34969 479 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CLCN5P51795 746 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 HECTD2Q5U5R9 776 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CYHR1Q6ZMK1 362 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC22A9Q8IVM8 553 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CASP10Q92851 521 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 GSTO2Q9H4Y5 243 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ARNT2Q9HBZ2 717 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM181Q9P2C4 612 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 NUDT5Q9UKK9 219 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1B0GTW7 788 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 MRASO14807 208 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 B3GAT3O94766 335 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 TSPAN8P19075 237 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 IMPDH1P20839 514 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 FGFR3P22607 806 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 RPL9P32969 192 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNC1P48547 511 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 CYTH1Q15438 398 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC14A2Q15849 920 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 KDELC1Q6UW63 502 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 TSPAN17Q96FV3 270 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC29A1Q99808 456 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF408Q9H9D4 720 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 CROTQ9UKG9 612 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 PADI4Q9UM07 663 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2-221ENST00000511747 ODC1P11926 461 aa27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms