RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IL12RB2Q99665 862 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLF15Q9UIH9 416 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLCA2Q9UQC9 943 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZZEF1O43149 2961 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEBLO76041 1014 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCF4P15884 667 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NFKBIAP25963 317 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HTR1BP28222 390 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SSR1P43307 286 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPARDQ03181 441 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM14Q14142 442 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRT81Q14533 505 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF235Q14590 738 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IRF4Q15306 451 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RALGPS1Q5JS13 557 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAXCQ5TGI0 409 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PHACTR4Q8IZ21 702 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATL2Q8NHH9 583 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LMX1AQ8TE12 382 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GLMNQ92990 594 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCG4Q9H172 646 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UVRAGQ9P2Y5 699 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LMO7DNF2Z398 122 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MUSKO15146 869 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OPA1O60313 960 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAFKO60675 156 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SOCS5O75159 536 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PEX11BO96011 259 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT-CO3P00414 261 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H2AFZP0C0S5 128 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPIAP49247 311 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDH6P55285 790 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTM1Q13496 603 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INPP5AQ14642 412 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RTP5Q14D33 572 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC18A3Q16572 532 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRRT3Q5FWE3 981 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MARC1Q5VT66 337 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H2AFVQ71UI9 128 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM71BQ8TC56 605 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BTBD6Q96KE9 485 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NENFQ9UMX5 172 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAXQ9Y2V3 346 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPSM3Q9Y4H4 160 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACACAQ13085 2346 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPEGQ15772 3267 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANXA6P08133 673 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TPM1P09493 284 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IL4RP24394 825 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLDN6P56747 220 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NFATC4Q14934 902 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DEFB133Q30KQ1 61 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LIPIQ6XZB0 460 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KDM7AQ6ZMT4 941 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DPPA4Q7L190 304 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TPCN2Q8NHX9 752 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC7Q99615 494 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MGME1Q9BQP7 344 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APOOQ9BUR5 198 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAAP1Q9H8G2 361 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCTD5Q9NXV2 234 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AK5Q9Y6K8 562 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 U3KQA8 63 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APC2O95996 2303 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM208BQ5VWN6 2430 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms