RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGLON5	A6NGN9	336 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	APOL1	O14791	398 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	VILL	O15195	856 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRKCG	P05129	697 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRT10	P13645	584 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCNC	P24863	283 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	CTSK	P43235	329 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MMP13	P45452	471 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	GSDMD	P57764	484 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	DYNLT1	P63172	113 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEMG2	Q02383	582 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADCY2	Q08462	1091 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRM3	Q14832	879 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ODF2	Q5BJF6	829 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAML1	Q92585	1016 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MGME1	Q9BQP7	344 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NOD2	Q9HC29	1040 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NT5M	Q9NPB1	228 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325		H0Y8X5	98 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NEMP1	O14524	444 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MATN3	O15232	486 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAD51B	O15315	384 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSPAN6	O43657	245 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERPINA4	P29622	427 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	NUDT1	P36639	197 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	BCL2L1	Q07817	233 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	IHH	Q14623	411 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	UGP2	Q16851	508 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCNY	Q8ND76	341 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	HDAC11	Q96DB2	347 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	LGMN	Q99538	433 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRP4	O75096	1905 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TLR4	O00206	839 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MMP20	O60882	483 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCNB1	P14635	433 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MX2	P20592	715 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	C21orf59	P57076	290 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLDN2	P57739	230 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	AP1S1	P61966	158 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITK	Q08881	620 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	STAT4	Q14765	748 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	KAZN	Q674X7	775 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	BBS5	Q8N3I7	341 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	FATE1	Q969F0	183 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	BMF	Q96LC9	184 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PRKCZ-222	ENST00000496325	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		15.95	■□□□□ 0.14
PRKCZ-222	ENST00000496325	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
PRKCZ-222	ENST00000496325	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
PRKCZ-222	ENST00000496325	CST8	O60676	142 aa		15.95	■□□□□ 0.14
PRKCZ-222	ENST00000496325	CER1	O95813	267 aa		15.95	■□□□□ 0.14
PRKCZ-222	ENST00000496325	HLA-DQB2	P05538	268 aa		15.95	■□□□□ 0.14
PRKCZ-222	ENST00000496325	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
PRKCZ-222	ENST00000496325	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
PRKCZ-222	ENST00000496325	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14

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