RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 RRN3Q9NYV6 651 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 MPP6Q9NZW5 540 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 MAP10Q9P2G4 905 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 POLHQ9Y253 713 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 OR1A2Q9Y585 309 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 MED13Q9UHV7 2174 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.21□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ITPR3Q14573 2671 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 B4E171 279 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 B4GAT1O43505 415 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 SRGAP2O75044 1071 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 DAB1O75553 588 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 GSRP00390 522 aa6.2□□□□□ -1.42
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CBX1-205ENST00000495350 COL8A1P27658 744 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 GNA15P30679 374 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 TSPAN7P41732 249 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 GPR3P46089 330 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 FMO5P49326 533 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 SUOXP51687 545 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ARSDP51689 593 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ARF5P84085 180 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 B4GALNT1Q00973 533 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 GNA12Q03113 381 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 MTM1Q13496 603 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 TAF5Q15542 800 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 MYLK3Q32MK0 819 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ANKS6Q68DC2 871 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ERAP2Q6P179 960 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 RRAGAQ7L523 313 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 TMEM110Q86TL2 294 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 DRC7Q8IY82 874 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ESX1Q8N693 406 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 PAF1Q8N7H5 531 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 PRR7Q8TB68 274 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 KAT5Q92993 513 aa6.2□□□□□ -1.42
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CBX1-205ENST00000495350 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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CBX1-205ENST00000495350 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 TMEM51Q9NW97 253 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 CFAP45Q9UL16 551 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.2□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 A0A1B0GVL5 298 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 DRGXA6NNA5 263 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 TNFRSF10CO14798 259 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ZMPSTE24O75844 475 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 STK17BO94768 372 aa6.19□□□□□ -1.42
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CBX1-205ENST00000495350 RNF224P0DH78 156 aa6.19□□□□□ -1.42
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CBX1-205ENST00000495350 PFKFB1P16118 471 aa6.19□□□□□ -1.42
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CBX1-205ENST00000495350 SULT1E1P49888 294 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 KIAA1024LP59773 190 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 GCNT1Q02742 428 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 DEUP1Q05D60 604 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.19□□□□□ -1.42
CBX1-205ENST00000495350 OR10G6Q8NH81 332 aa6.19□□□□□ -1.42
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