RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 EGFL7Q9UHF1 273 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 USP3Q9Y6I4 520 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SNAP91O60641 907 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 S100A1P23297 94 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PTPN9P43378 593 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SLC7A2P52569 658 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ADIGQ0VDE8 80 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SEMA5AQ13591 1074 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 C9orf131Q5VYM1 1079 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 LIPMQ5VYY2 423 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 C4orf22Q6V702 233 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 OSTM1Q86WC4 334 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 NT5DC4Q86YG4 428 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ARRDC4Q8NCT1 418 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ACVR1CQ8NER5 493 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ARNTL2Q8WYA1 636 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MUC3BQ9H195 1237 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PKD2L2Q9NZM6 624 aa13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MATN1P21941 496 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 KCNJ8Q15842 424 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PGS1Q32NB8 556 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 STEAP4Q687X5 459 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 HFE2Q6ZVN8 426 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CYS1Q717R9 158 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 BTLAQ7Z6A9 289 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 NPLOC4Q8TAT6 608 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 HTR3CQ8WXA8 447 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SEPT3Q9UH03 358 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 B4GAT1O43505 415 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CYP2C9P11712 490 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CA8P35219 290 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SULT1E1P49888 294 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 BCAT1P54687 386 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 HERC3Q15034 1050 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CARTPTQ16568 116 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DEPDC1Q5TB30 811 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SYPL2Q5VXT5 272 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ARHGAP17Q68EM7 881 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 GPR142Q7Z601 462 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PIGZQ86VD9 579 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SPPL2CQ8IUH8 684 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TERB1Q8NA31 727 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RBBP8Q99708 897 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FANCEQ9HB96 536 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 VTI1BQ9UEU0 232 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 OAZ3Q9UMX2 235 aa13.56□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PIRO00625 290 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MRASO14807 208 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MYF6P23409 242 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 OCA2Q04671 838 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DNASE1L3Q13609 305 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 NOTUMQ6P988 496 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 UTS2BQ765I0 119 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ZNF354CQ86Y25 554 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TTC39CQ8N584 583 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 LRRC52Q8N7C0 313 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PDZD8Q8NEN9 1154 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TPK1Q9H3S4 243 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CROTQ9UKG9 612 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DOCK3Q8IZD9 2030 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 CLPXO76031 633 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 IL10P22301 178 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 PSMB4P28070 264 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 RAD23AP54725 363 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 BCL2A1Q16548 175 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 REP15Q6BDI9 236 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 DHRSXQ8N5I4 330 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 NAT16Q8N8M0 369 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 OR52K1Q8NGK4 314 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MORF4L1Q9UBU8 362 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 MEIS3P2A8K0S8 358 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 TOR1BO14657 336 aa13.55□□□□□ -0.24
NISCH-212ENST00000488380 SLC22A2O15244 555 aa13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms