RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 STRA6Q9BX79 667 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3G-206ENST00000486357 PANK2Q9BZ23 570 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3G-206ENST00000486357 MTG2Q9H4K7 406 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3G-206ENST00000486357 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3G-206ENST00000486357 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3G-206ENST00000486357 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3G-206ENST00000486357 DKK4Q9UBT3 224 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3G-206ENST00000486357 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTPRJQ12913 1337 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.4□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTPRDP23468 1912 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A087WV48 116 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PLK4O00444 970 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CAPN9O14815 690 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF883P0CG24 379 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRKCAP17252 672 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITPKBP27987 946 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAN1A1P33908 653 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 STAT6P42226 847 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TUBP50607 506 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TPMTP51580 245 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 HK3P52790 923 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDH8P55286 799 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MYL6P60660 151 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MGAT2Q10469 447 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUP43Q8NFH3 380 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM9Q9C026 710 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CIPCQ9C0C6 399 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 FBXO44Q9H4M3 255 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 OLFML3Q9NRN5 406 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PADI4Q9UM07 663 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 NME7Q9Y5B8 376 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SCINQ9Y6U3 715 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ACACAQ13085 2346 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A0A6YYJ9 748 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCNJ18B7U540 433 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 NPC1O15118 1278 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MDM4O15151 490 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLIC2O15247 247 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC16A6O15403 523 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIF20AO95235 890 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYBBP04839 570 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 HMBSP08397 361 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CISD3P0C7P0 127 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 HSD3B1P14060 373 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 STT3AP46977 705 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYP2J2P51589 502 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 C21orf59P57076 290 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAP3K7CLP57077 242 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 IL9RQ01113 521 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 BNC1Q01954 994 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 E2F5Q15329 346 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 KIF19Q2TAC6 998 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ACOT1Q86TX2 421 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 TP53INP1Q96A56 240 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARL8AQ96BM9 186 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 NXPE2Q96DL1 559 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 MPP4Q96JB8 637 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 CD248Q9HCU0 757 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 COMMD8Q9NX08 183 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3G-206ENST00000486357 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms