RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484298.5

ALMS1-204, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALMS1, Length 12,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ALMS1-204ENST00000484298 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.58□□□□□ -0.88
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ALMS1-204ENST00000484298 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.58□□□□□ -0.88
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