RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482272.5

CTDSP1-208, Transcript of CTD small phosphatase 1, human

TSL 2

Gene CTDSP1, Length 984 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDSP1-208	ENST00000482272	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	USP12	O75317	370 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	CS	O75390	466 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	CTSE	P14091	401 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	PCK1	P35558	622 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	PBX1	P40424	430 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	LIG3	P49916	1009 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	RENBP	P51606	427 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	BCL2L1	Q07817	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	IL10RB	Q08334	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	AGER	Q15109	404 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	IRF4	Q15306	451 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ELOC	Q15369	112 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	BOLA3	Q53S33	107 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	FIGN	Q5HY92	759 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	APOO	Q9BUR5	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	BOC	Q9BWV1	1114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ISCU	Q9H1K1	167 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	SYCE3	A1L190	88 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272		H3BRJ5	948 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	YY2	O15391	372 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	LRCH4	O75427	683 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	GCAT	O75600	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ALPI	P09923	528 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	C6	P13671	934 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	TSHR	P16473	764 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	IL1R2	P27930	398 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ITPKB	P27987	946 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ARL4A	P40617	200 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	SCNN1B	P51168	640 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	INPP5A	Q14642	412 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	LUZP1	Q86V48	1076 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	WDR48	Q8TAF3	677 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	NAT6	Q93015	286 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	MUSK	O15146	869 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	RASGRP1	O95267	797 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	TNF	P01375	233 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	PRKCG	P05129	697 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	TGM2	P21980	687 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	LSS	P48449	732 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	HK3	P52790	923 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	GABRE	P78334	506 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	MTM1	Q13496	603 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	NFATC4	Q14934	902 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ISX	Q2M1V0	245 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	GUSBP11	Q6P575	273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	GKN2	Q86XP6	184 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	HID1	Q8IV36	788 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	BBS5	Q8N3I7	341 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	ZNF599	Q96NL3	588 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	LRRC61	Q9BV99	259 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	CLPB	Q9H078	707 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	SEPT3	Q9UH03	358 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	KNTC1	P50748	2209 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CTDSP1-208	ENST00000482272		A0A1W2PQ67	120 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CTDSP1-208	ENST00000482272	TCEA3	O75764	348 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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