RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 HIF1AQ16665 826 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 UGP2Q16851 508 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 SIRPB2Q5JXA9 342 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD22Q5VYY1 191 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 KIAA1211LQ6NV74 962 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ERAP2Q6P179 960 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 TMEM92Q6UXU6 159 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 CCNJLQ8IV13 435 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 TSTD1Q8NFU3 115 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 MYRIPQ8NFW9 859 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 PIH1D2Q8WWB5 315 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 PEX13Q92968 403 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 FAM131CQ96AQ9 280 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 RMDN1Q96DB5 314 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 SIPA1Q96FS4 1042 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 SCRN2Q96FV2 425 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 NSMCE3Q96MG7 304 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 SERPINB12Q96P63 405 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 FMO2Q99518 471 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 NAT9Q9BTE0 207 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 MAGEE1Q9HCI5 957 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 BFARQ9NZS9 450 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 FZD4Q9ULV1 537 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 CHKBQ9Y259 395 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ESYT3A0FGR9 886 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ANTXRLA6NF34 631 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 CAPN8A6NHC0 703 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 TP73O15350 636 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 CTIFO43310 598 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 AP1G1O43747 822 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ZNF217O75362 1048 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 APBB3O95704 486 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 AGTP01019 485 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ACADMP11310 421 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ZNF30P17039 623 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 COL9A1P20849 921 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 HOXA6P31267 233 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 GKP32189 559 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 PSMD8P48556 350 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 GAS6Q14393 721 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 QPCTQ16769 361 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 DENND5AQ6IQ26 1287 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 FBXL19Q6PCT2 694 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ZDHHC24Q6UX98 284 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 CENPUQ71F23 418 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 NLRP9Q7RTR0 991 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 LPCAT1Q8NF37 534 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 FBXO25Q8TCJ0 367 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 BRSK1Q8TDC3 778 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 IFT81Q8WYA0 676 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 MRGPRX1Q96LB2 322 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 RANBP9Q96S59 729 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 KDM4CQ9H3R0 1056 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 EBF1Q9UH73 591 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 SARDHQ9UL12 918 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 RIMKLBQ9ULI2 386 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 SDR42E2A6NKP2 422 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 E7ESA3 106 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 H0Y858 1186 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 CRTAMO95727 393 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 IGLV3-19P01714 112 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 PDHA1P08559 390 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ADRB3P13945 408 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 GABRG2P18507 467 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 OXTRP30559 389 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 CXCL12P48061 93 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 GALNT3Q14435 633 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 SLMAPQ14BN4 828 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ZNF534Q76KX8 674 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 TTC7BQ86TV6 843 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 RASSF3Q86WH2 238 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 RELL1Q8IUW5 271 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 OR52K1Q8NGK4 314 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 OMDQ99983 421 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 KCTD5Q9NXV2 234 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 RAB21Q9UL25 225 aa13.1□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD36A6QL64 1941 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 HEATR9A2RTY3 570 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 C2orf81A6NN90 581 aa13.09□□□□□ -0.31
NISCH-208ENST00000481211 PSMD11O00231 422 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms