RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230	CES5A	Q6NT32	575 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230	GPAT4	Q86UL3	456 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230	OTULIN	Q96BN8	352 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		5.16	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230	PTPRG	P23470	1445 aa		5.15	□□□□□ -1.58
NFU1-209	ENST00000474230		A0A0U1RQJ8	604 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	WNT9B	O14905	357 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	POU1F1	P28069	291 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CHAT	P28329	748 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TAF11	Q15544	211 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ESX1	Q8N693	406 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TMED6	Q8WW62	240 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PPM1E	Q8WY54	764 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	HVCN1	Q96D96	273 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	APOPT1	Q96IL0	206 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	FIZ1	Q96SL8	496 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	NUF2	Q9BZD4	464 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	IL25	Q9H293	177 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CEP170	Q5SW79	1584 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SHROOM2	Q13796	1616 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TAF4	O00268	1085 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	LDLRAD4	O15165	306 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CH25H	O95992	272 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ART1	P52961	327 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	UFM1	P61960	85 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ARHGEF6	Q15052	776 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TXNDC8	Q6A555	127 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	NOXA1	Q86UR1	476 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ERGIC1	Q969X5	290 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	RNF125	Q96EQ8	232 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	WDR26	Q9H7D7	661 aa		5.14	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ACOT8	O14734	319 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	NDUFB4	O95168	129 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TGFB3	P10600	412 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PIGA	P37287	484 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TUB	P50607	506 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	HDAC4	P56524	1084 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	GRIK3	Q13003	919 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	NFATC4	Q14934	902 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	DLK2	Q6UY11	383 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	RRM2B	Q7LG56	351 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SHF	Q7M4L6	423 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	ST8SIA4	Q92187	359 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	LRFN5	Q96NI6	719 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	EEA1	Q15075	1411 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230		A0A1W2PQM1	296 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	CPED1	A4D0V7	1026 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	IFNL4	K9M1U5	179 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	HSPA12A	O43301	675 aa		5.12	□□□□□ -1.59
NFU1-209	ENST00000474230	F9	P00740	461 aa		5.12	□□□□□ -1.59

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