RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473542.1

BBX-223, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 3

Gene BBX, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-223	ENST00000473542	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HCRTR2	O43614	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	AHCYL1	O43865	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	NDUFS3	O75489	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	RARG	P13631	454 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MYF6	P23409	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CHAT	P28329	748 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HADHA	P40939	763 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	LPIN1	Q14693	890 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542		Q5PR19	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	WASF1	Q92558	559 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BBX-223	ENST00000473542	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542		A6NNC1	897 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	KLK8	O60259	260 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	MTA2	O94776	668 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	CLDN7	O95471	211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	PRR35	P0CG20	571 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	EDN2	P20800	178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	KEL	P23276	732 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	AVPR1A	P37288	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	CXCR3	P49682	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	GAD2	Q05329	585 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	MTX1	Q13505	466 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	DUSP6	Q16828	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BBX-223	ENST00000473542	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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