RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470197.5

GCFC2-205, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 1 (best)

Gene GCFC2, Length 3,648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-205	ENST00000470197	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PEAK1	Q9H792	1746 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GJC1	P36383	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DIO1	P49895	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CAMP	P49913	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NTRK2	Q16620	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	BTAF1	O14981	1849 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CHD4	Q14839	1912 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	HRK	O00198	91 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	BCL10	O95999	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	INHBA	P08476	426 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GNAT2	P19087	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PRELP	P51888	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CRYM	Q14894	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	UTRN	P46939	3433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	STAM2	O75886	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FURIN	P09958	794 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CCDC175	P0C221	793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ITGAX	P20702	1163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PCSK6	P29122	969 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GPD2	P43304	727 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PCP4	P48539	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NLRP14	Q86W24	1093 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DPP10	Q8N608	796 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CORO2A	Q92828	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PTER	Q96BW5	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CBY3	A6NI87	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	DSCR3	O14972	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GAP43	P17677	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	HOXC8	P31273	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	LIG4	P49917	911 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GNAQ	P50148	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197		Q6ZRM9	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCFC2-205	ENST00000470197	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms