RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 RAD54BQ9Y620 910 aa6.06□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.06□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 SUPT3HO75486 399 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 STC2O76061 302 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 HSPA4LO95757 839 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00271P0C7V0 271 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 PYGBP11216 843 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 HLA-EP13747 358 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 TAC1P20366 129 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 SLC1A1P43005 524 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ECT2LQ008S8 904 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 RIPK1Q13546 671 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 BMPR2Q13873 1038 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC14Q49A88 953 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ERAP2Q6P179 960 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 TTC7BQ86TV6 843 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 OLFM3Q96PB7 478 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 EDEM2Q9BV94 578 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 FCHO1O14526 889 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 KRT38O76015 456 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 IGSF6O95976 241 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 PRNPP04156 253 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ITGAVP06756 1048 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ATP6V1C1P21283 382 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 AQP5P55064 265 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF33AQ06730 810 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ART3Q13508 389 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 BLMHQ13867 455 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 CNGA3Q16281 694 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 EML3Q32P44 896 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 IYDQ6PHW0 289 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 CDKL2Q92772 493 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 GLMNQ92990 594 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 AIM2O14862 343 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 SLC31A1O15431 190 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 PDE5AO76074 875 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 MPLP40238 635 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 CDH6P55285 790 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 STX3Q13277 289 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 CRY1Q16526 586 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 IL21Q9HBE4 155 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 CYLDQ9NQC7 956 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 PDP2Q9P2J9 529 aa6.05□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 BEST1O76090 585 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 RBP3P10745 1247 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 GZMAP12544 262 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 HTR1BP28222 390 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 ECHS1P30084 290 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 GSTT1P30711 240 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1-205ENST00000468371 FOXN2P32314 431 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms