RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	KCNA4	P22459	653 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PEX5	P50542	639 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	SUOX	P51687	545 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	DSC2	Q02487	901 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PPP2R5E	Q16537	467 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	KIF19	Q2TAC6	998 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ALG3	Q92685	438 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	OLFM3	Q96PB7	478 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	GAREM1	Q9H706	876 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		17.89	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TSPAN11	A1L157	253 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902		A8MX80	341 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	C10orf142	B7Z368	130 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	KCNK3	O14649	394 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	VILL	O15195	856 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	SPINT1	O43278	529 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	SOCS5	O75159	536 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	CER1	O95813	267 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PYGM	P11217	842 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	HLA-B	Q31612	363 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PPM1J	Q5JR12	505 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	AADACL2	Q6P093	401 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	BBS12	Q6ZW61	710 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	AGAP3	Q96P47	875 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	AMACR	Q9UHK6	382 aa		17.88	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PQ67	120 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902		H7C0C1	242 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TLR4	O00206	839 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TM7SF2	O76062	418 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	CP	P00450	1065 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	WNT1	P04628	370 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	CES1	P23141	567 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ATP5O	P48047	213 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	CLDN2	P57739	230 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	BNC1	Q01954	994 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TRAF2	Q12933	501 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB17	Q13105	803 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	FGL2	Q14314	439 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	IL12RB2	Q99665	862 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		17.87	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PR77	199 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	MAGEC1	O60732	1142 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TJP3	O95049	919 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	ADRB1	P08588	477 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	NFKBIA	P25963	317 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	LIG3	P49916	1009 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	EPHB1	P54762	984 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	IL21R	Q9HBE5	538 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	GDF3	Q9NR23	364 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		17.86	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902		H0Y8X5	98 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	FPGT	O14772	594 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	RAD51B	O15315	384 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PGLS	O95336	258 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	APOC2	P02655	101 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	CA4	P22748	312 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	MMP12	P39900	470 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	CD86	P42081	329 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	CTSK	P43235	329 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	CNTD1	Q8N815	330 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	HES6	Q96HZ4	224 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	17.85	■□□□□ 0.45
USP19-210	ENST00000465902	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		17.85	■□□□□ 0.45

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