RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 PEX11BO96011 259 aa18.43■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 RHOQP17081 205 aa18.43■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 TBX4P57082 545 aa18.43■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 SLC10A7Q0GE19 358 aa18.43■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 ADGRE1Q14246 886 aa18.43■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 GRM2Q14416 872 aa18.43■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 FBXL19Q6PCT2 694 aa18.43■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA24Q86W54 205 aa18.43■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 OR13J1Q8NGT2 312 aa18.43■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 MEAF6Q9HAF1 191 aa18.43■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 VWA7Q9Y334 891 aa18.43■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.43■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.42■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 CEP350Q5VT06 3117 aa18.42■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 UBXN10Q96LJ8 280 aa18.41■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 FBXO44Q9H4M3 255 aa18.41■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 SCML2Q9UQR0 700 aa18.41■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa18.41■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 MS4A13Q5J8X5 152 aa18.41■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 ARPINQ7Z6K5 226 aa18.41■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 GALNT7Q86SF2 657 aa18.41■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 HDAC10Q969S8 669 aa18.41■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 SLC39A13Q96H72 371 aa18.41■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 TMEM248Q9NWD8 314 aa18.41■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 PSME3P61289 254 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 SLC14A2Q15849 920 aa18.4■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 ASB9Q96DX5 294 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 MFSD1Q9H3U5 465 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 ALG9Q9H6U8 611 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 CCL22O00626 93 aa18.4■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 GSTT1P30711 240 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 EFEMP1Q12805 493 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 TLR1Q15399 786 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 ALFQ53S48 1182 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 GPR158Q5T848 1215 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 SPNS2Q8IVW8 549 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 MFN1Q8IWA4 741 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa18.4■□□□□ 0.54
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SYNE4-204ENST00000465425 SH3GL3Q99963 347 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 TRMOQ9BU70 441 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 NOD1Q9Y239 953 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 PATJQ8NI35 1801 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 NLRC5Q86WI3 1866 aa18.4■□□□□ 0.54
SYNE4-204ENST00000465425 ACOT8O14734 319 aa18.39■□□□□ 0.53
SYNE4-204ENST00000465425 MMP2P08253 660 aa18.39■□□□□ 0.53
SYNE4-204ENST00000465425 CYBAP13498 195 aa18.39■□□□□ 0.53
SYNE4-204ENST00000465425 PMLP29590 882 aa18.39■□□□□ 0.53
SYNE4-204ENST00000465425 GPR162Q16538 588 aa18.39■□□□□ 0.53
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