RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ITKQ08881 620 aa24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF542PQ5EBM4 170 aa24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 RALGPS1Q5JS13 557 aa24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 KDM7AQ6ZMT4 941 aa24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TEX26Q8N6G2 289 aa24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 IFT43Q96FT9 208 aa24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TSGA13Q96PP4 275 aa24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC28Q9NX36 388 aa24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF487B1APH4 448 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 MATN3O15232 486 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 SOCS5O75159 536 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 CCNCP24863 283 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 FZD2Q14332 565 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC14Q15048 493 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC157Q569K6 752 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 VSIG1Q86XK7 387 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 CCNYQ8ND76 341 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 LRRN4Q8WUT4 740 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TOR4AQ9NXH8 423 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 DTLQ9NZJ0 730 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TFR2Q9UP52 801 aa24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1W2PQ67 120 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 NEBLO76041 1014 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 DGKAP23743 735 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 THOP1P52888 689 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 IRF4Q15306 451 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 DPPA4Q7L190 304 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 PARGQ86W56 976 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 SLC25A45Q8N413 288 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 PLD5Q8N7P1 536 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 MAML1Q92585 1016 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 FATE1Q969F0 183 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 SEMA3CQ99985 751 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 HAUS2Q9NVX0 235 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 KLK13Q9UKR3 277 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 HEY1Q9Y5J3 304 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 ALG6Q9Y672 507 aa24.11■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP69A5D8W1 941 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 A8MX80 341 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 ENC1O14682 589 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 APOL1O14791 398 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 PIAS2O75928 621 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 NDUFA10O95299 355 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 CPP00450 1065 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 ELFN1P0C7U0 828 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 CCNB1P14635 433 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 FECHP22830 423 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 YPEL5P62699 121 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TRAF2Q12933 501 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 RALGDSQ12967 914 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 PTK2BQ14289 1009 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 WSCD2Q2TBF2 565 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TPRG1LQ5T0D9 272 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 RFX6Q8HWS3 928 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 SPOCK2Q92563 424 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 CAAP1Q9H8G2 361 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 UCKL1Q9NWZ5 548 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TTLL3Q9Y4R7 772 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa24.1■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 TOR1BO14657 336 aa24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 SLC9A4Q6AI14 798 aa24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 LIPIQ6XZB0 460 aa24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC13Q8IYE1 715 aa24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 HDAC11Q96DB2 347 aa24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 B4GALT6Q9UBX8 382 aa24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 AMACRQ9UHK6 382 aa24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 LRRK1Q38SD2 2015 aa24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 H3BM21 787 aa24.08■■□□□ 1.45
SMKR1-201ENST00000462322 FFAR2O15552 330 aa24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms