RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 BNC1Q01954 994 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 ADCY2Q08462 1091 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 OVGP1Q12889 678 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM52BQ4KMG9 183 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 ARMC12Q5T9G4 340 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 BBS12Q6ZW61 710 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 OSBPL8Q9BZF1 889 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 CA5BQ9Y2D0 317 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-202ENST00000460308 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.58■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 DCDC2BA2VCK2 349 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 SPINT1O43278 529 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 PRKCGP05129 697 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 CTSKP43235 329 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 DSC2Q02487 901 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 IQCHQ86VS3 1027 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ZSWIM9Q86XI8 627 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 NDUFAF2Q8N183 169 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ASB12Q8WXK4 309 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ALG3Q92685 438 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 HAUS1Q96CS2 278 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 IL12RB2Q99665 862 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 LZTFL1Q9NQ48 299 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 GDF3Q9NR23 364 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 DFNA5O60443 496 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 TJP3O95049 919 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 CPP00450 1065 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 PYGMP11217 842 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 CA4P22748 312 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 TRAF2Q12933 501 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 FGL2Q14314 439 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM145Q8NBT3 493 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 FAM174AQ8TBP5 190 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 AGAP3Q96P47 875 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 KCNK3O14649 394 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 FPGTO14772 594 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 MTSS1O43312 755 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 PGLSO95336 258 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 APOC2P02655 101 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 THEGLP0DJG4 465 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 PTPN7P35236 360 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 CLDN2P57739 230 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 SEMG2Q02383 582 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ZBTB17Q13105 803 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 SLC14A1Q13336 389 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF662Q6ZS27 426 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 CEP41Q9BYV8 373 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 IL21RQ9HBE5 538 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 HACD1B0YJ81 288 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 H7C0C1 242 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF883P0CG24 379 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 MMP12P39900 470 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ATP5OP48047 213 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 LIG3P49916 1009 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 EPHB1P54762 984 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 NXPH1P58417 271 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 NIPAL4Q0D2K0 466 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF423Q2M1K9 1284 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 TEX44Q53QW1 395 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 DENND6BQ8NEG7 585 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 ARRDC2Q8TBH0 407 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 SPOCK2Q92563 424 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 HES6Q96HZ4 224 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 FERMT1Q9BQL6 677 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 TM7SF3Q9NS93 570 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 CFAP69A5D8W1 941 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 A6NNZ2 444 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 A8MX80 341 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 H0Y8X5 98 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 TM4SF5O14894 197 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD4-202ENST00000460308 RAD51BO15315 384 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms