RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 BTBD9Q96Q07 612 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SNX6Q9UNH7 406 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 A8MX80 341 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TRMUO75648 421 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GALK1P51570 392 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PPIL2Q13356 520 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 C6orf52Q5T4I8 152 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 DPP10Q8N608 796 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CNTD1Q8N815 330 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 NAT14Q8WUY8 206 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PROX1Q92786 737 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 BORCS5Q969J3 196 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 EHD3Q9NZN3 535 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 FETUBQ9UGM5 382 aa11.24□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PRR23AA6NEV1 266 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MFSD11O43934 449 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TSPAN19P0C672 248 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 DBTP11182 482 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TCF3P15923 654 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 POLD2P49005 469 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CDK18Q07002 472 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 HSPA14Q0VDF9 509 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 DLG2Q15700 870 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CRY2Q49AN0 593 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TFAP2BQ92481 460 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 AAASQ9NRG9 546 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 LGR5O75473 907 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 IPO13O94829 963 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ABL2P42684 1182 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 LIMK2P53671 638 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 VGLL4Q14135 290 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 RFX4Q33E94 735 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 RALGPS1Q5JS13 557 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OFCC1Q8IZS5 231 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 KLHL23Q8NBE8 558 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PSMA8Q8TAA3 256 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MYLPFQ96A32 169 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 NXNL1Q96CM4 212 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 REPS1Q96D71 796 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ADAM2Q99965 735 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GALNT8Q9NY28 637 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MDM4O15151 490 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PDE9AO76083 593 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PAICSP22234 425 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PROSER1Q86XN7 944 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 ARL10Q8N8L6 244 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 UCMAQ8WVF2 138 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 S100ZQ8WXG8 99 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CDCA5Q96FF9 252 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 MRC1P22897 1456 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 KCNU1A8MYU2 1149 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 M0R2N6 131 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GCATO75600 419 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OTCP00480 354 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CLTBP09497 229 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 CDH3P22223 829 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 PRDX6P30041 224 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 WEE1P30291 646 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TM4SF1P30408 202 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 EPHX2P34913 555 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 GDF10P55107 478 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 LPIN1Q14693 890 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM35AQ86V20 835 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2T34Q8NGX1 318 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2T3Q8NH03 318 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 OR4L1Q8NH43 312 aa11.23□□□□□ -0.61
SEMA4D-211ENST00000438547 SLCO2A1Q92959 643 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms