RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOR1BO14657 336 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 APOL1O14791 398 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 INSIG1O15503 277 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCDHGA12O60330 932 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SOCS5O75159 536 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TM7SF2O76062 418 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCNK5O95279 499 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT10P13645 584 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CD59P13987 128 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CR2P20023 1033 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GJC1P36383 396 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CETN2P41208 172 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABL2P42684 1182 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MMP13P45452 471 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RXRGP48443 463 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP2CBP62714 309 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP2CAP67775 309 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BNC1Q01954 994 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIF5AQ12840 1032 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AGERQ15109 404 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PDK1Q15118 436 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TAZQ16635 292 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERAP2Q6P179 960 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DAAM2Q86T65 1068 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM139Q8IV31 216 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KATNAL2Q8IYT4 538 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EXD1Q8NHP7 514 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIAA1524Q8TCG1 905 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EXOC2Q96KP1 924 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MGME1Q9BQP7 344 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DTLQ9NZJ0 730 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CFAP54Q96N23 3096 aa8.21□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A1B0GTQ1 180 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGLON5A6NGN9 336 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FPGTO14772 594 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC31A1O15431 190 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FLRT2O43155 660 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MFSD11O43934 449 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIGNO95427 931 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT1P04264 644 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WNT1P04628 370 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCNB1P14635 433 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RABIFP47224 123 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RGRP47804 291 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NXPH1P58417 271 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 YPEL5P62699 121 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GBE1Q04446 702 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 INAVAQ3KP66 663 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LINC01559Q495D7 138 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPM1JQ5JR12 505 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIAA1328Q86T90 577 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC13Q8IYE1 715 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLD5Q8N7P1 536 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPC24Q8NBT2 197 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NETO2Q8NC67 525 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCNYQ8ND76 341 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDC6Q99741 560 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NOD2Q9HC29 1040 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.16e-7■■■■□ 20.6
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPIL1Q9Y3C6 166 aa8.2□□□□□ -1.1
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms