RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 PCDH8O95206 1070 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TIAF1O95411 115 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CD160O95971 181 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 RHOCP08134 193 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SLC2A3P11169 496 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CXCR3P49682 368 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SLC6A3Q01959 620 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CETN1Q12798 172 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 STIM1Q13586 685 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CDKN3Q16667 212 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ISXQ2M1V0 245 aa6.67□□□□□ -1.34
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HOXD8-202ENST00000429017 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SHC3Q92529 594 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 HDAC8Q9BY41 377 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 IL36AQ9UHA7 158 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 GGT7Q9UJ14 662 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SATB2Q9UPW6 733 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 DBX1A6NMT0 343 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 A6NNZ2 444 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 J3QKU1 62 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CSF2P04141 144 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 GP1BAP07359 652 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ADRB3P13945 408 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 GKP32189 559 aa6.66□□□□□ -1.34
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HOXD8-202ENST00000429017 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 RBFAQ8N0V3 343 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 MAPK15Q8TD08 544 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 NT5C3BQ969T7 300 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 WBP1Q96G27 269 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.66□□□□□ -1.34
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HOXD8-202ENST00000429017 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ITM2BQ9Y287 266 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ATMQ13315 3056 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TENM4Q6N022 2769 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 BICDL2A1A5D9 508 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CPED1A4D0V7 1026 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 IGLON5A6NGN9 336 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 GCATO75600 419 aa6.65□□□□□ -1.34
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