RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 J3KR12 359 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CST8O60676 142 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 EPOP01588 193 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 IL2RAP01589 272 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CDK4P11802 303 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 TCF4P15884 667 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF30P17039 623 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CR2P20023 1033 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 GLDCP23378 1020 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 GJC1P36383 396 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PEX5P50542 639 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 SCNN1BP51168 640 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 C21orf59P57076 290 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 YPEL5P62699 121 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CNTN1Q12860 1018 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 UGP2Q16851 508 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 USP45Q70EL2 814 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 NLRP8Q86W28 1048 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 NPWQ8N729 165 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PQLC3Q8N755 202 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 BIRC7Q96CA5 298 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 OLFM3Q96PB7 478 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 IL12RB2Q99665 862 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 LHX3Q9UBR4 397 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 HEY1Q9Y5J3 304 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.98□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 MACROD2A1Z1Q3 448 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 FPGTO14772 594 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 AREL1O15033 823 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PSMD3O43242 534 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 ANXA9O76027 345 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 TM7SF2O76062 418 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 FSBPO95073 299 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PCDH8O95206 1070 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PEX11BO96011 259 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 UGT2B4P06133 528 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CTSLP07711 333 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CD48P09326 243 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 BCKDHBP21953 392 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 KELP23276 732 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 ITPKAP23677 461 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CD38P28907 300 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 ACTN2P35609 894 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PTGER3P43115 390 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 RABIFP47224 123 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 FOXK2Q01167 660 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC10A7Q0GE19 358 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 SPEM2Q0P670 501 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 AP1B1Q10567 949 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 FOXC1Q12948 553 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PEX6Q13608 980 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PTK2BQ14289 1009 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 RPS6KA1Q15418 735 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 TEX44Q53QW1 395 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM124AQ86V42 546 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CHST14Q8NCH0 376 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 SCRN2Q96FV2 425 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.97□□□□□ -0.97
PAICSP3-201ENST00000428007 CAPN10Q9HC96 672 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms