RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 IFNA2P01563 188 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 TFP02787 698 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 HEXAP06865 529 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 ACADMP11310 421 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 PLA2G2AP14555 144 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 CDC25AP30304 524 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 DCTDP32321 178 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 ICAM3P32942 547 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 TTKP33981 857 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 RYKP34925 604 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 PBX3P40426 434 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-208ENST00000427110 OLR1P78380 273 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-208ENST00000427110 MAMLD1Q13495 774 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-208ENST00000427110 ERV3-1Q14264 604 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
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PTPRC-208ENST00000427110 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
PTPRC-208ENST00000427110 DCAF12L2Q5VW00 463 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-208ENST00000427110 MON1BQ7L1V2 547 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-208ENST00000427110 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRC-208ENST00000427110 USP17L23D6RBM5 183 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRC-208ENST00000427110 IFNL4K9M1U5 179 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRC-208ENST00000427110 RBFAQ8N0V3 343 aa2.53□□□□□ -2
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