RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa11.06□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2ABP04908 130 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB10P61026 200 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CACUL1Q86Y37 369 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CHPFQ8IZ52 775 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2ACQ93077 130 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TINF2Q9BSI4 451 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TMCO1Q9UM00 188 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 EDF1O60869 148 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP1A2P05177 515 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MYBL2P10244 700 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 NR2F1P10589 423 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNB1P14635 433 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 NPR3P17342 541 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 EPORP19235 508 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 GLRA2P23416 452 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CD86P42081 329 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK8P45983 427 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP14P50281 582 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC7A2P52569 658 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 LPIN1Q14693 890 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC39A12Q504Y0 691 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SCIMPQ6UWF3 145 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 NPNTQ6UXI9 565 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC55Q6ZSA7 311 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF44Q7L0R7 432 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PIGZQ86VD9 579 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CLYBLQ8N0X4 340 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SPACA7Q96KW9 195 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 LAMA4Q16363 1823 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 OPLAHO14841 1288 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 KPNA5O15131 536 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PGRMC2O15173 223 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PIAS1O75925 651 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MARCKSL1P49006 195 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 THOP1P52888 689 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 INSCQ1MX18 579 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC5A9Q2M3M2 681 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CD101Q93033 1021 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PANX1Q96RD7 426 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RHBGQ9H310 441 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 KCND1Q9NSA2 647 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CPA4Q9UI42 421 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 FSCN2O14926 492 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 AZIN1O14977 448 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 NADKO95544 446 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 OTCP00480 354 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CHRNGP07510 517 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPAN8P19075 237 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH3P22223 829 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPGP40121 348 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC26A3P40879 764 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 OAZ1P54368 228 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CXCL9Q07325 125 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 AKIRIN2Q53H80 203 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 LIPMQ5VYY2 423 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB128Q7Z7B8 93 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PQLC1Q8N2U9 271 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SUSD6Q92537 303 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ART4Q93070 314 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 SEMA3CQ99985 751 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ING4Q9UNL4 249 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 IRAK3Q9Y616 596 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ABATP80404 500 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TAPT1Q6NXT6 567 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM220AQ7Z4H9 259 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TRABD2AQ86V40 505 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 TNS4Q8IZW8 715 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 RDH11Q8TC12 318 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 GIPC3Q8TF64 312 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 BTBD9Q96Q07 612 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms