RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 HDAC11Q96DB2 347 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ECHDC3Q96DC8 303 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 BMFQ96LC9 184 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1B0GTQ1 180 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNK1O00180 336 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CST8O60676 142 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 JCHAINP01591 159 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 AP1B1Q10567 949 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF5AQ12840 1032 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 TRAF2Q12933 501 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 TFDP2Q14188 446 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 TAZQ16635 292 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM7AQ6ZMT4 941 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 Q6ZSR6 202 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 FPGTO14772 594 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 DFNA5O60443 496 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 LIG3P49916 1009 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 DSC2Q02487 901 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PDK1Q15118 436 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 SHBQ15464 509 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 GATAD2AQ86YP4 633 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 RHBDD1Q8TEB9 315 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ASB12Q8WXK4 309 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRK1Q38SD2 2015 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 GRID2IPA4D2P6 1211 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 GOLGA8CPA6NN73 597 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 A6NNZ2 444 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 HLA-DQB2P05538 268 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 MMP12P39900 470 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ADCY2Q08462 1091 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 RALGPS1Q5JS13 557 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 EXD1Q8NHP7 514 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 FATE1Q969F0 183 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 HEMGNQ9BXL5 484 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP41Q9BYV8 373 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 SEPT10Q9P0V9 454 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 BTBD3Q9Y2F9 522 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 RAI2Q9Y5P3 530 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
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HTATSF1-202ENST00000425695 CPP00450 1065 aa25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 C6P13671 934 aa25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 BNIP3Q12983 259 aa25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 TFDP3Q5H9I0 405 aa25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CENPTQ96BT3 561 aa25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 OLFM3Q96PB7 478 aa25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 CAAP1Q9H8G2 361 aa25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa25.15■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 NCOR2Q9Y618 2525 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHGA12O60330 932 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 NIPAL4Q0D2K0 466 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 RALGDSQ12967 914 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB17Q13105 803 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 IHHQ14623 411 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 ARMC12Q5T9G4 340 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 DBX2Q6ZNG2 339 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC57Q8N9N7 239 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 HAUS1Q96CS2 278 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 HAUS2Q9NVX0 235 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 AMACRQ9UHK6 382 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 PHTF1Q9UMS5 762 aa25.14■■□□□ 1.62
HTATSF1-202ENST00000425695 FLRT2O43155 660 aa25.13■■□□□ 1.61
HTATSF1-202ENST00000425695 PGLSO95336 258 aa25.13■■□□□ 1.61
HTATSF1-202ENST00000425695 ITGAVP06756 1048 aa25.13■■□□□ 1.61
HTATSF1-202ENST00000425695 PDHA1P08559 390 aa25.13■■□□□ 1.61
HTATSF1-202ENST00000425695 CTPS1P17812 591 aa25.13■■□□□ 1.61
HTATSF1-202ENST00000425695 IGFALSP35858 605 aa25.13■■□□□ 1.61
HTATSF1-202ENST00000425695 FOXK2Q01167 660 aa25.13■■□□□ 1.61
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