RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 CDH17Q12864 832 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 NRF1Q16656 503 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 FAM26DQ5JW98 314 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 GK5Q6ZS86 529 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TSPAN14Q8NG11 270 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 LZICQ8WZA0 190 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TOP1MTQ969P6 601 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 KIFC1Q9BW19 673 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ACOT9Q9Y305 439 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 RNF11Q9Y3C5 154 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 GMEB1Q9Y692 573 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 AK5Q9Y6K8 562 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TTC3P53804 2025 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM233B4DJY2 109 aa24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 IRAK2O43187 625 aa24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CYP2C18P33260 490 aa24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CCNYL1Q8N7R7 359 aa24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 OSBPL11Q9BXB4 747 aa24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 COQ10BQ9H8M1 238 aa24.7■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 AP3B1O00203 1094 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 AHSGP02765 367 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF23P17027 643 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 TYMPP19971 482 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 GABRB3P28472 473 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 PGFP49763 221 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 SLC5A3P53794 718 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 CYTH1Q15438 398 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 PELI3Q8N2H9 469 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 ABCC13Q9NSE7 274 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.7■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 A0A1B0GTW7 788 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 IKBKEQ14164 716 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 TSTD2Q5T7W7 516 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 GAB3Q8WWW8 586 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 GPR78Q96P69 363 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 UBP1Q9NZI7 540 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 TNFRSF10BO14763 440 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 DNAJB2P25686 324 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 GRIK1P39086 918 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 RAB10P61026 200 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 COG7P83436 770 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 RHDQ02161 417 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 UGP2Q16851 508 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 BTBD8Q5XKL5 378 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 NXNL1Q96CM4 212 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 CCT7Q99832 543 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa24.69■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC78A2IDD5 438 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 E7ENX8 843 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 B4GALT3O60512 393 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF33AQ06730 810 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 CARM1Q86X55 608 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 NUP93Q8N1F7 819 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 LRTOMTQ8WZ04 291 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 FAM210AQ96ND0 272 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 PCDHAC1Q9H158 963 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.68■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 DFFAO00273 331 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 INPPL1O15357 1258 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 PAGE1O75459 146 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 POLD2P49005 469 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 STX5Q13190 355 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF460Q14592 562 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 OTOP3Q7RTS5 596 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 SCD5Q86SK9 330 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 TRIML2Q8N7C3 387 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 USP33Q8TEY7 942 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 CASP10Q92851 521 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 TSGA13Q96PP4 275 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 MRGBPQ9NV56 204 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 SARDHQ9UL12 918 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 MSI1O43347 362 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 H6PDO95479 791 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 ALDH1A1P00352 501 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 OR4Q2P0C623 313 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC166P0CW27 439 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 ALDH3B2P48448 385 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 PRPSAP1Q14558 356 aa24.67■■□□□ 1.54
FAAP20-206ENST00000414253 MAPRE2Q15555 327 aa24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms