RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 NUDT2P50583 147 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 PIGGQ5H8A4 983 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 CHSY3Q70JA7 882 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A9Q8IVM8 553 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 DLG3Q92796 817 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 VWCEQ96DN2 955 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 TRMOQ9BU70 441 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 H3BNX3 289 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 CLTBP09497 229 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 DSC1Q08554 894 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 ACAP2Q15057 778 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 PIK3R6Q5UE93 754 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 MARC1Q5VT66 337 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 TRIM67Q6ZTA4 783 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 UBXN10Q96LJ8 280 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa23.94■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 MYLKQ15746 1914 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 FAM92AA1XBS5 289 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 CCDC78A2IDD5 438 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 MROH6A6NGR9 719 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 UQCRBP14927 111 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 TBX4P57082 545 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 SHKBP1Q8TBC3 707 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 AGR3Q8TD06 166 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 HASPINQ8TF76 798 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 MFSD1Q9H3U5 465 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 HIPK3Q9H422 1215 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.93■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 AIM2O14862 343 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 ITGB1P05556 798 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 PSMD8P48556 350 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 PGFP49763 221 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 MAPRE2Q15555 327 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 PELI3Q8N2H9 469 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 SCLYQ96I15 445 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 POMKQ9H5K3 350 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 RGS18Q9NS28 235 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 MPP6Q9NZW5 540 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 MYO16Q9Y6X6 1858 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 PITPNM1O00562 1244 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 SDHDO14521 159 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 NEMP1O14524 444 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 NBNO60934 754 aa23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 ZMPSTE24O75844 475 aa23.92■■□□□ 1.42
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PMS1-205ENST00000409985 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.92■■□□□ 1.42
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PMS1-205ENST00000409985 CATSPER1Q8NEC5 780 aa23.92■■□□□ 1.42
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PMS1-205ENST00000409985 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.92■■□□□ 1.42
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PMS1-205ENST00000409985 MEAF6Q9HAF1 191 aa23.91■■□□□ 1.42
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PMS1-205ENST00000409985 DRGXA6NNA5 263 aa23.9■■□□□ 1.42
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PMS1-205ENST00000409985 CHRNA4P43681 627 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 CCR10P46092 362 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 ACVR1Q04771 509 aa23.9■■□□□ 1.42
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PMS1-205ENST00000409985 MED21Q13503 144 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 ZNF460Q14592 562 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 MS4A13Q5J8X5 152 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 PQLC1Q8N2U9 271 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 RETREG1Q9H6L5 497 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 DOCK4Q8N1I0 1966 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 SYN3O14994 580 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 EPOP01588 193 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 FESP07332 822 aa23.9■■□□□ 1.42
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