RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 UCMAQ8WVF2 138 aa20.63■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 HLA-CQ95604 372 aa20.63■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.63■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 ARNTLO00327 626 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 SOCS5O75159 536 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 KAT7O95251 611 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 PGLSO95336 258 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 APODP05090 189 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 PAMP19021 973 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 ATP5DP30049 168 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 LAMB3Q13751 1172 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 QPCTQ16769 361 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 CYS1Q717R9 158 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 KCNMB4Q86W47 210 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 TDRPQ86YL5 185 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 SFTPA1Q8IWL2 248 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF366Q8N895 744 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 CHST14Q8NCH0 376 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 FRS2Q8WU20 508 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 CHFRQ96EP1 664 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 MTG2Q9H4K7 406 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 ZFATQ9P243 1243 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 FZD6O60353 706 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 SLC4A1P02730 911 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 C1QAP02745 245 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 GRM3Q14832 879 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 ARMC3Q5W041 872 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 DEFB123Q8N688 67 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 GUCD1Q96NT3 240 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 SMIM14Q96QK8 99 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 ARL5AQ9Y689 179 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 VAPBO95292 243 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 CRTAMO95727 393 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 UGT2B4P06133 528 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 CTPS1P17812 591 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 GRIA2P42262 883 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 ABL2P42684 1182 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 GRIA4P48058 902 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 CNGA3Q16281 694 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 CYP4X1Q8N118 509 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 KCTD3Q9Y597 815 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 UGT1A9O60656 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 FAM155BO75949 473 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 KRT15P19012 456 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 PLPP6Q8IY26 295 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 KCNK12Q9HB15 430 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 TREX1Q9NSU2 369 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 EURLQ9NYK6 297 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 MROH6A6NGR9 719 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 LDB2O43679 373 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 HLA-EP13747 358 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 TMPRSS15P98073 1019 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 NAB1Q13506 487 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-204ENST00000402096 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms