RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 MANSC1Q9H8J5 431 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 SLC28A3Q9HAS3 691 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 GGT7Q9UJ14 662 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 SLC39A10Q9ULF5 831 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 KCTD3Q9Y597 815 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 PRLP01236 227 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 PDHA1P08559 390 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 MAPK8P45983 427 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 CD151P48509 253 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 TRAF2Q12933 501 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 FAM47EQ6ZV65 393 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC63Q8NA47 563 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 LMLNQ96KR4 655 aa27.55■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 CHD7Q9P2D1 2997 aa27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 C2orf81A6NN90 581 aa27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 ANKRD66B4E2M5 251 aa27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 TYRP14679 529 aa27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 HLA-FP30511 346 aa27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 ACVR1Q04771 509 aa27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 USP10Q14694 798 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 PPM1JQ5JR12 505 aa27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 TRIM42Q8IWZ5 723 aa27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 SLC25A13Q9UJS0 675 aa27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 GGA2Q9UJY4 613 aa27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 WNT6Q9Y6F9 365 aa27.54■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 RPP40O75818 363 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 IGSF6O95976 241 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 GABRB3P28472 473 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 CSNK1DP48730 415 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 EPHB1P54762 984 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 TMPRSS15P98073 1019 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 LY6G5CQ5SRR4 150 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 RAPH1Q70E73 1250 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 PPP2R3CQ969Q6 453 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 CAB39LQ9H9S4 337 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 TLK1Q9UKI8 766 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 A0A096LPK6 155 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 BUD23O43709 281 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 GSTA1P08263 222 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 SAT1P21673 171 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 ARSDP51689 593 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 TBATAQ96M53 351 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 DZANK1Q9NVP4 752 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 PHTF1Q9UMS5 762 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 SPO11Q9Y5K1 396 aa27.53■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 MYOFQ9NZM1 2061 aa27.52■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 GLP2RO95838 553 aa27.52■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 BCL2L1Q07817 233 aa27.52■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 PAF1Q8N7H5 531 aa27.52■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa27.52■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa27.52■■■□□ 2
MSRB2-201ENST00000376510 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 CCL22O00626 93 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 SNX3O60493 162 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 WEE1P30291 646 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 SULT2A1Q06520 285 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 DMC1Q14565 340 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 FUT11Q495W5 492 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 ARMC12Q5T9G4 340 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 NUDCD3Q8IVD9 361 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 OR13C4Q8NGS5 318 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 TSNARE1Q96NA8 513 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 IGFLR1Q9H665 355 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC85CA6NKD9 419 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 BIRC5O15392 142 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 HAUS5O94927 633 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 C2P06681 752 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 SLC12A2P55011 1212 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 SPATA21Q7Z572 469 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 GALNT7Q86SF2 657 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 CILP2Q8IUL8 1156 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 EFHBQ8N7U6 833 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 ELMO2Q96JJ3 720 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 SLC2A11Q9BYW1 496 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 HACD3Q9P035 362 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 MARK1Q9P0L2 795 aa27.51■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 CHD9Q3L8U1 2897 aa27.5■■□□□ 1.99
MSRB2-201ENST00000376510 EDF1O60869 148 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms