RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 STX2P32856 288 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 WASP42768 502 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 Q6ZVU0 165 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 TDRPQ86YL5 185 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 CYTH2Q99418 400 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 MGME1Q9BQP7 344 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 FICDQ9BVA6 458 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 MTG2Q9H4K7 406 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PPCSQ9HAB8 311 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 EURLQ9NYK6 297 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 BFARQ9NZS9 450 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 NTSR1P30989 418 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 RGRP47804 291 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP1A2P50993 1020 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 DSC2Q02487 901 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 CDH17Q12864 832 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 TMED2Q15363 201 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 CYP4X1Q8N118 509 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 FLCNQ8NFG4 579 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PTPRN2Q92932 1015 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 FETUBQ9UGM5 382 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKRD36A6QL64 1941 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 BNIP3LO60238 219 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 ADAM23O75077 832 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 EPHX1P07099 455 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PGAM1P18669 254 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP5DP30049 168 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 CD86P42081 329 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 MPP3Q13368 585 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 STEAP4Q687X5 459 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 CCNJLQ8IV13 435 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PAFAH2Q99487 392 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 GABRG3Q99928 467 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 AP3B1O00203 1094 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 GJB3O75712 270 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 TPH1P17752 444 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 ADRA1AP35348 466 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 NPY2RP49146 381 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PPP2R2AP63151 447 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PCSK7Q16549 785 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 SDE2Q6IQ49 451 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 KDELC1Q6UW63 502 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 NAT9Q9BTE0 207 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 SUN2Q9UH99 717 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 IGSF6O95976 241 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 GSRP00390 522 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 C1QAP02745 245 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 MMP2P08253 660 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 CR2P20023 1033 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 MSH2P43246 934 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 SCNN1BP51168 640 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 WNT3AP56704 352 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 GAS6Q14393 721 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 CARD16Q5EG05 197 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 PLPP6Q8IY26 295 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 CLDN23Q96B33 292 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-204ENST00000373436 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms