RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 AFMIDQ63HM1 303 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA6LQ8N4H0 392 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 BTBD9Q96Q07 612 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCC13Q9NSE7 274 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 NPHS1O60500 1241 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CCR1P32246 355 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIP10Q15642 601 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGGQ5H8A4 983 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 PNPLA1Q8N8W4 532 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 MRGPRX2Q96LB1 330 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CATSPER2Q96P56 530 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 OMDQ99983 421 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.9■□□□□ 0.623e-59■■■■■ 48
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM161AQ9NX61 479 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 PACSIN3Q9UKS6 424 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 PMPCBO75439 489 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 GSTT1P30711 240 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 PSMD5Q16401 504 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF423Q2M1K9 1284 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 RCN3Q96D15 328 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CDRT15Q96T59 188 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPKQ9BS16 269 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-201ENST00000357436 VWA8A3KMH1 1905 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CD151P48509 253 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 RASIP1Q5U651 963 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ELMO2Q96JJ3 720 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 UROC1Q96N76 676 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO5Q9UKT4 447 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PSMD13Q9UNM6 376 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A087X1B8 175 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ALDH2P05091 517 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PAMP19021 973 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 THOP1P52888 689 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF470Q6ECI4 717 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CCNYL1Q8N7R7 359 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 HEXDCQ8WVB3 486 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 FSD1LQ9BXM9 530 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 HIPK3Q9H422 1215 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MIA3Q5JRA6 1907 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CHRNA4P43681 627 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJB13P59910 316 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 POU4F1Q01851 419 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MMEL1Q495T6 779 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 AP1ARQ63HQ0 302 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 NXNQ6DKJ4 435 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PGAM4Q8N0Y7 254 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PHF24Q9UPV7 400 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 AP1G1O43747 822 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 OAZ2O95190 189 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TYMPP19971 482 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TAF10Q12962 218 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PQLC1Q8N2U9 271 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNU1A8MYU2 1149 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM233B4DJY2 109 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 VNN2O95498 520 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TLE2Q04725 743 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM60Q495X7 471 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 NEPROQ6NW34 567 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 FUT10Q6P4F1 479 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 MYEOVQ96EZ4 313 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKD2Q9BZL6 878 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 IGSF5Q9NSI5 407 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 HS3ST4Q9Y661 456 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 AURKAO14965 403 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CNTN5O94779 1100 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 PDK3Q15120 406 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 CNSTQ6PJW8 725 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA0408Q6ZU52 694 aa18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms