RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.38■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.38■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.38■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 EI24O14681 340 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ACOX3O15254 700 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 MTSS1O43312 755 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 HSD17B1P14061 328 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GNA12Q03113 381 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 PRPSAP1Q14558 356 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 BCL2A1Q16548 175 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 DEFB106AQ8N104 65 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 C7orf31Q8N865 590 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 SNX31Q8N9S9 440 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 RAB2BQ8WUD1 216 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 NCAM2O15394 837 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GPIP06744 558 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF24P17028 368 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 MATN1P21941 496 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CLCN3P51790 818 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP2A13Q16696 494 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM187BQ17R55 369 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF773Q6PK81 442 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 NRBF2Q96F24 287 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 NME7Q9Y5B8 376 aa20.37■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 NFKB1P19838 968 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ADORA2BP29275 332 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 NOS2P35228 1153 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TUBA3CQ13748 450 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CYBRD1Q53TN4 286 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 IGFN1Q86VF2 1251 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 DDIASQ8IXT1 998 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ADGRG5Q8IZF4 528 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 HDAC10Q969S8 669 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 KIF12Q96FN5 646 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC78A2IDD5 438 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 MYL3P08590 195 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TNK2Q07912 1038 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 USP51Q70EK9 711 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 FRA10AC1Q70Z53 315 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 UNC93AQ86WB7 457 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TRPV3Q8NET8 790 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CASP10Q92851 521 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 70.6
PPP1CC-201ENST00000335007 TAMM41Q96BW9 452 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 SNX27Q96L92 541 aa20.36■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CITO14578 2027 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 NEMP2A6NFY4 417 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 DAB1O75553 588 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 SEC14L2O76054 403 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TGFB3P10600 412 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 HMGCS2P54868 508 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 RETREG3Q86VR2 466 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CPB2Q96IY4 423 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC138Q96M89 665 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 NANOGQ9H9S0 305 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 PSME2Q9UL46 239 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 TNFAIP1Q13829 316 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBTB46Q86UZ6 589 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 C12orf42Q96LP6 360 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 FANCEQ9HB96 536 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 COX16Q9P0S2 106 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.35■□□□□ 0.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms