RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 RMDN1Q96DB5 314 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MFSD1Q9H3U5 465 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TLR9Q9NR96 1032 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MYO7AQ13402 2215 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 LINC01553A4QN01 128 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ITM2AO43736 263 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MT-CO1P00395 513 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 DLDP09622 509 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MYOGP15173 224 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 IRS1P35568 1242 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ARFIP2P53365 341 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R39P59534 338 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 PRAMEP78395 509 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CCDC15Q0P6D6 951 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 GPR158Q5T848 1215 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 KIAA0408Q6ZU52 694 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 OR13C4Q8NGS5 318 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ZNF398Q8TD17 642 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 KCTD4Q8WVF5 259 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 NMRAL1Q9HBL8 299 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CCL26Q9Y258 94 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ZNF510Q9Y2H8 683 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 RAI2Q9Y5P3 530 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MYOFQ9NZM1 2061 aa17.99■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 G3V2L1 256 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC6O75061 913 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CES1P23141 567 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 POLD2P49005 469 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 RAB10P61026 200 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ACVR1Q04771 509 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 BNIP1Q12981 228 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SLC12A1Q13621 1099 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CILP2Q8IUL8 1156 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CPXM2Q8N436 756 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 LPCAT1Q8NF37 534 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 NDNQ99608 321 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 OMDQ99983 421 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 THAP1Q9NVV9 213 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 NUMBLQ9Y6R0 609 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 NOTCH4Q99466 2003 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 K7ERQ8 282 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 DCTN3O75935 186 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 GOT2P00505 430 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 KITP10721 976 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 STMN1P16949 149 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TRAF2Q12933 501 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 LAMB3Q13751 1172 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SETDB1Q15047 1291 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MPPE1Q53F39 396 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 NCEH1Q6PIU2 408 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ATG14Q6ZNE5 492 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MDGA1Q8NFP4 955 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ERP27Q96DN0 273 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 LRRC37BQ96QE4 947 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TASP1Q9H6P5 420 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MAN1C1Q9NR34 630 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ACOT9Q9Y305 439 aa17.98■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CCDC162PA2VCL2 907 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 GRM6O15303 877 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MOSPD3O75425 235 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 RPP40O75818 363 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 S1PR4O95977 384 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 RALBP11234 206 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SLC8A1P32418 973 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 GLRBP48167 497 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SLC1A6P48664 564 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 RHOAP61586 193 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 DLG1Q12959 904 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ITGA9Q13797 1035 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CAMK1Q14012 370 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 TEAD2Q15562 447 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CRLF3Q8IUI8 442 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SPATA6LQ8N4H0 392 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SH3RF2Q8TEC5 729 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SCYL1Q96KG9 808 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ECT2Q9H8V3 914 aa17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SERPINE1P05121 402 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 SBK3P0C264 359 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 MYL2P10916 166 aa17.96■□□□□ 0.47
ACTB-201ENST00000331789 EPCAMP16422 314 aa17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms