RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316433.8

ZNF540-201, Transcript of zinc finger protein 540, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF540, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF540-201ENST00000316433 CUL2Q13617 745 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 IKBKEQ14164 716 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 Q3ZCU0 254 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 MFSD4AQ8N468 514 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 OR8K3Q8NH51 312 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ZFP90Q8TF47 636 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 GJA10Q969M2 543 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 SCYL1Q96KG9 808 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 SERPINI1Q99574 410 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 SP110Q9HB58 689 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 IL37Q9NZH6 218 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 SNX7Q9UNH6 387 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 RAD54BQ9Y620 910 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ISPDA4D126 451 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 LEUTXA8MZ59 168 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 PRSS44E7EML9 344 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ST8SIA5O15466 376 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 NDST3O95803 873 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ITGB5P18084 799 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 IMPDH1P20839 514 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 AXLP30530 894 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 RGS7P49802 495 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 WDR44Q5JSH3 913 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 AGAP6Q5VW22 663 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 REPS2Q8NFH8 660 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 GTF2H4Q92759 462 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 AGAP4Q96P64 663 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ASB2Q96Q27 587 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 BCO2Q9BYV7 579 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 CHST7Q9NS84 486 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 MTRRQ9UBK8 725 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 CLIC2O15247 247 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 CLDN3O15551 220 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 APOC2P02655 101 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 PCSK2P16519 638 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ZNF3P17036 446 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 TGM2P21980 687 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 CYP2C18P33260 490 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 GRIA1P42261 906 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ACOT2P49753 483 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 NDST1P52848 882 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ERVK-21P61565 698 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 TRIM32Q13049 653 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 MMRN1Q13201 1228 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 BFSP2Q13515 415 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 FLOT2Q14254 428 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 KCTD2Q14681 263 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 NEDD8Q15843 81 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 SV2AQ7L0J3 742 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 SNAPC3Q92966 411 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 FAM117AQ9C073 453 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 ACP6Q9NPH0 428 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF540-201ENST00000316433 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms