RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304954.3

CSN3-201, Transcript of casein kappa, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN3, Length 836 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3-201ENST00000304954 SKA1Q96BD8 255 aa4.96□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 LYZL4Q96KX0 146 aa4.96□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 LRFN5Q96NI6 719 aa4.96□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ZNF570Q96NI8 536 aa4.96□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 MAP7D2Q96T17 732 aa4.96□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 EBF3Q9H4W6 596 aa4.96□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ASAH2Q9NR71 780 aa4.96□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 HAO1Q9UJM8 370 aa4.96□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4.96□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 I6L893 689 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CLEC3BP05452 202 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PRSS2P07478 247 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ATP1A3P13637 1013 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ETFAP13804 333 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CLDN2P57739 230 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 Q0VFX4 171 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 HLFQ16534 295 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 EVI5LQ96CN4 794 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 NUF2Q9BZD4 464 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 OR6C3Q9NZP0 311 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SELENONQ9NZV5 590 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.95□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 INAFM1C9JVW0 142 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SEC14L5O43304 696 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SERPINI2O75830 405 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 GAGE7O76087 117 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 RGS11O94810 467 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 VNN2O95498 520 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 DDX58O95786 925 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SCGB1D1O95968 90 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SPARCP09486 303 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 GAGE12FP0CL80 117 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 GAGE12GP0CL81 117 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 GAGE12IP0CL82 117 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 T-ENOLP0DO92 83 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 AGAP20933 346 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 THPOP40225 353 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 HARS2P49590 506 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 GAGE1Q13065 139 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 GAGE4Q13068 117 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 TRAF1Q13077 416 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 OLIG2Q13516 323 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 C6orf141Q5SZD1 244 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CPLX4Q7Z7G2 160 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 MAGEC3Q8TD91 643 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 UCMAQ8WVF2 138 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 OIT3Q8WWZ8 545 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 POMGNT1Q8WZA1 660 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SGCDQ92629 289 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ZBTB9Q96C00 473 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 HARBI1Q96MB7 349 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SH3GL2Q99962 352 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 STRA6Q9BX79 667 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 EHD2Q9NZN4 543 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ERVK-11Q9UQG0 969 aa4.94□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 BAIAP3O94812 1187 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 TBX18O95935 607 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CD4P01730 458 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ARL3P36405 182 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 OLR1P78380 273 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 MYBPC2Q14324 1141 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 USP41Q3LFD5 358 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 SHFQ7M4L6 423 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ADSSL1Q8N142 457 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PELI3Q8N2H9 469 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 AADATQ8N5Z0 425 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 ELP5Q8TE02 316 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 EVPLQ92817 2033 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 PHF21BQ96EK2 531 aa4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CSN3-201ENST00000304954 TMEM68Q96MH6 324 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 259.3 ms