RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 SOBPA7XYQ1 873 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 HACD1B0YJ81 288 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 TM7SF2O76062 418 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 VCLP18206 1134 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 AQP4P55087 323 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 MMEL1Q495T6 779 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UBE2B-201ENST00000265339 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PDK3Q15120 406 aa20.52■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.52■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 AFMIDQ63HM1 303 aa20.52■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 HTR3DQ70Z44 454 aa20.52■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 GPR149Q86SP6 731 aa20.52■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 LZTR1Q8N653 840 aa20.52■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.52■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.52■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.52■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM221A6NGB7 291 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN3O60637 253 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CDK4P11802 303 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TREML1Q86YW5 311 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CCNYQ8ND76 341 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 RTP4Q96DX8 246 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TDP1Q9NUW8 608 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SH3GLB1Q9Y371 365 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 DFFAO00273 331 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 HDAC11Q96DB2 347 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PAFAH2Q99487 392 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 RMI1Q9H9A7 625 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 NCAM2O15394 837 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 MX2P20592 715 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 FUT4P22083 530 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CHN2P52757 468 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ADAM15Q13444 863 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 VPS11Q9H270 941 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 GPAMQ9HCL2 828 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 GFRA2O00451 464 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ADGRE1Q14246 886 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CLEC1BQ9P126 229 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 FKBP6O75344 327 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CPT1BQ92523 772 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 P2RY11Q96G91 374 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PPCSQ9HAB8 311 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 FSHRP23945 695 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 OR1E1P30953 314 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 NDST2P52849 883 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R14BQ96C90 147 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 S100A14Q9HCY8 104 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF711Q9Y462 761 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 C5orf42Q9H799 3197 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PHBP35232 272 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 MAPKAPK2P49137 400 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CDH4P55283 916 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms