RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 FZD3Q9NPG1 666 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 C4orf47A7E2U8 309 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 NRDCO43847 1150 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 MMP20O60882 483 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CES1P23141 567 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PTPN3P26045 913 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CD38P28907 300 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 MMP12P39900 470 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 RALGDSQ12967 914 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TEX44Q53QW1 395 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ACTL9Q8TC94 416 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ASB12Q8WXK4 309 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TMEM131Q92545 1883 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SLC30A4O14863 429 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PGLSO95336 258 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SYPP08247 313 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CTSKP43235 329 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SKOR1P84550 965 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 XRCC4Q13426 336 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PTPRRQ15256 657 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TADA1Q96BN2 335 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 BMFQ96LC9 184 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TEKT5Q96M29 485 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 H0Y8X5 98 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 NEMP1O14524 444 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 GM2AP17900 193 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ELP6Q0PNE2 266 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 GCNT7Q6ZNI0 430 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 MFSD2AQ8NA29 543 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CENPTQ96BT3 561 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 AGAP3Q96P47 875 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SMIM14Q96QK8 99 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 MYOCQ99972 504 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 IL21RQ9HBE5 538 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 HACD1B0YJ81 288 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 KCNK3O14649 394 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TJP3O95049 919 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CLDN2P57739 230 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TEAD4Q15561 434 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 HLA-BQ31612 363 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CFAP58Q5T655 872 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 DPPA4Q7L190 304 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TLR10Q9BXR5 811 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQ67 120 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 POM121BA6NF01 834 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 TLR4O00206 839 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 RBL1P28749 1068 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 CD86P42081 329 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 LIG3P49916 1009 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 NXPH1P58417 271 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 FAM193AP78312 1265 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 STAT4Q14765 748 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ARMC12Q5T9G4 340 aa22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms