RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173740.1

Lgr5-208, Transcript of Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mouse

TSL 5 BASIC

Gene Lgr5, Length 2,508 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gstt2	Q61133	244 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Eif2b4	Q61749	524 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Map3k7	Q62073	579 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ripor1	Q68FE6	1223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Smg5	Q6ZPY2	1017 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Itpkc	Q7TS72	678 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Lrrc19	Q8BZT5	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Zbtb9	Q8CDC7	459 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Acad9	Q8JZN5	625 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Dhx36	Q8VHK9	1001 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Setd7	Q8VHL1	366 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Trim7	Q923T7	510 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mrps18a	Q99N85	196 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Retreg3	Q9CQV4	466 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Anks3	Q9CZK6	655 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Spc24	Q9D083	201 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Htra3	Q9D236	459 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Actrt1	Q9D9J3	376 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Znf654	Q9DAU9	571 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Vmn2r25	W4VSP2	855 aa		11.64	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Zfp626	A0A0U1RQ84	676 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ifi206	G3UZV2	921 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fgf10	O35565	209 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sept7	O55131	436 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ctbp1	O88712	441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sp1	O89090	784 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Smad1	P70340	465 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Kcnj13	P86046	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Togaram2	Q3TYG6	1002 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gpr65	Q61038	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Lcp1	Q61233	627 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hesx1	Q61658	185 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ankrd6	Q69ZU8	712 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Maml1	Q6T264	1020 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc38a9	Q8BGD6	560 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Znf76	Q8BMU0	568 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc39a13	Q8BZH0	361 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rbm34	Q8C5L7	375 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ago1	Q8CJG1	857 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Glcci1	Q8K3I9	537 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Taf12	Q8VE65	161 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Klhdc8b	Q9D2D9	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Prss23	Q9D6X6	382 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ovca2	Q9D7E3	225 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mpp6	Q9JLB0	553 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm12248	A0A1W2P8B8	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	2210016F16Rik	G3X8U3	338 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Arfip1	G5E8V9	373 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Vmn2r86	G5E8Y4	848 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sult3a2	G5E904	293 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Chil3	O35744	398 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Prkag1	O54950	330 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Coro1a	O89053	461 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740		P01670	111 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740		P01671	111 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740		P01672	111 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gas2	P11862	314 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ndst2	P52850	883 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Nudt1	P53368	156 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc24a2	Q14BI1	711 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc17a7	Q3TXX4	560 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Prss53	Q571E5	552 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	B3gnt3	Q5JCS9	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc30a1	Q60738	503 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Arnt2	Q61324	712 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gas6	Q61592	674 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Krt75	Q8BGZ7	551 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rbm22	Q8BHS3	420 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Noc4l	Q8BHY2	516 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fndc3a	Q8BX90	1198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fcho1	Q8K285	873 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tmem82	Q8R115	356 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Vmn1r213	Q8R278	384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Themis3	Q9CU24	569 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mkks	Q9JI70	570 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mylk	Q6PDN3	1941 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mcm3ap	Q9WUU9	1971 aa		11.63	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Igkv10-94	A0A075B5L1	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Zfp758	E9QAA1	583 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Spin2f	J3QPU0	254 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm379	J3QQ19	296 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Dcpp3	L7N259	170 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Galnt4	O08832	578 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Exoc7	O35250	697 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Anxa8	O35640	327 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Eef1b	O70251	225 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ldhc	P00342	332 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Camk4	P08414	469 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc2a7	P0C6A1	513 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Crhr1	P35347	415 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Phb	P67778	272 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Foxred2	Q3USW5	665 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Trcg1	Q58Y74	825 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mreg	Q6NVG5	214 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Snph	Q80U23	495 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Scara3	Q8C850	606 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Scai	Q8C8N2	606 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740		Q8CIL4	281 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Trim61	Q8JZK6	461 aa		11.62	□□□□□ -0.55
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Pglyrp2	Q8VCS0	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39 ms