RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619348.4

CYFIP1-211, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYFIP1, Length 3,471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-211ENST00000619348 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.11■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 NOS1P29475 1434 aa16.11■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF445P59923 1031 aa16.1■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 CABP1Q9NZU7 370 aa16.1■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 DYNC1I1O14576 645 aa16.1■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 ERC2O15083 957 aa16.1■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 PHF14O94880 888 aa16.1■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 TTC22Q5TAA0 569 aa16.1■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 CFAP44Q96MT7 982 aa16.1■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.09■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.09■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 USP26Q9BXU7 913 aa16.09■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF592Q92610 1267 aa16.09■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 TMX3Q96JJ7 454 aa16.09■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 PRAM1Q96QH2 718 aa16.09■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.09■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.08■□□□□ 0.17
CYFIP1-211ENST00000619348 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.08■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.08■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.08■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 ERVK-7P63135 1459 aa16.08■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 MBIPQ9NS73 344 aa16.08■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 HMMRO75330 724 aa16.07■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 VAMP4O75379 141 aa16.07■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 DDIT3P35638 169 aa16.07■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 FYB1O15117 783 aa16.07■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 PTPRTO14522 1441 aa16.07■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.06■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 ABCC11Q96J66 1382 aa16.06■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.06■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 F6X3S4 739 aa16.06■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.06■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 KIF3AQ9Y496 699 aa16.06■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 KCNJ4P48050 445 aa16.06■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 AK9Q5TCS8 1911 aa16.05■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.05■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 ADCY5O95622 1261 aa16.05■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.05■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.05■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 MEIS3Q99687 375 aa16.04■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 FCHSD2O94868 740 aa16.04■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 SYNMO15061 1565 aa16.04■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 ZMYM3Q14202 1370 aa16.04■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 SLC4A2P04920 1241 aa16.04■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.163e-8■□□□□ 8.6
CYFIP1-211ENST00000619348 NFE2L2Q16236 605 aa16.04■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 HS1BP3Q53T59 392 aa16.03■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa16.03■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.02■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.02■□□□□ 0.16
CYFIP1-211ENST00000619348 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 MCM10Q7L590 875 aa16.02■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 PDCL2Q8N4E4 241 aa16.02■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 IFT57Q9NWB7 429 aa16.02■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 NPHP1O15259 732 aa16.02■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.02■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 USP48Q86UV5 1035 aa16.02■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.02■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.01■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 CLASP1Q7Z460 1538 aa16■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 ZNF428Q96B54 188 aa16■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 DUOX2Q9NRD8 1548 aa16■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 MCM5P33992 734 aa15.99■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 CDK19Q9BWU1 502 aa15.99■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 DCTPP1Q9H773 170 aa15.99■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 SMC3Q9UQE7 1217 aa15.99■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.99■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.99■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 CAMK4Q16566 473 aa15.99■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 FERMT3Q86UX7 667 aa15.99■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.99■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 IL16Q14005 1332 aa15.98■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.98■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 FBXW7Q969H0 707 aa15.98■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 ATP10AO60312 1499 aa15.98■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.98■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 A0A1W2PP64 1363 aa15.97■□□□□ 0.15
CYFIP1-211ENST00000619348 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms