RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A0G2JS52 829 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 FYB1O15117 783 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYT1Q01538 1121 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACEP12821 1306 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 COG3Q96JB2 828 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA0232Q92628 1395 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUDCQ9Y266 331 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 AKAP12Q02952 1782 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHRNA2Q15822 529 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC3-210ENST00000617904 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-210ENST00000617904 NGEFQ8N5V2 710 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-210ENST00000617904 MTHFSP49914 203 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM182BQ5T319 152 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP6P35125 1406 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-210ENST00000617904 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC3-210ENST00000617904 BAG6P46379 1132 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-210ENST00000617904 STRN4Q9NRL3 753 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-210ENST00000617904 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDE3BQ13370 1112 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABTB2Q8N961 1025 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP19O94966 1318 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 CPDO75976 1380 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 NME9Q86XW9 330 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 SSH2Q76I76 1423 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 NEFLP07196 543 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 NEFMP07197 916 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 EVA1CP58658 441 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 DISP2A7MBM2 1401 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 GCP02774 474 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 BARGINQ6ZT62 677 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC3-210ENST00000617904 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP35Q9P2H5 1018 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRP5O75197 1615 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP31Q70CQ4 1352 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM37O94972 964 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 RUNDC1Q96C34 613 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-210ENST00000617904 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 POLKQ9UBT6 870 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 NLRP6P59044 892 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLIT3O75094 1523 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 APBA3O96018 575 aa22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIK3C2AO00443 1686 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRB1P82279 1406 aa22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL18A1P39060 1754 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 FCHSD2O94868 740 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 APAF1O14727 1248 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 GOLGA2Q08379 1002 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP54Q70EL1 1684 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 AMPHP49418 695 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC3-210ENST00000617904 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.98■■□□□ 1.11
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