RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617806.4

BECN1-222, Transcript of beclin 1, human

TSL 5

Gene BECN1, Length 4,865 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BECN1-222	ENST00000617806	NES	P48681	1621 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
BECN1-222	ENST00000617806	CDK19	Q9BWU1	502 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	SPATA32	Q96LK8	384 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	SEC24B	O95487	1268 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	MARCH6	O60337	910 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	CAMK4	Q16566	473 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	13.32	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	STK38	Q15208	465 aa		13.32	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ME1	P48163	572 aa		13.31	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.31	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.31	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	HIP1	O00291	1037 aa		13.31	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	NLRP6	P59044	892 aa		13.31	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	SERPINC1	P01008	464 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	CCP110	O43303	1012 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	MX1	P20591	662 aa		13.29	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	SIL1	Q9H173	461 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	AK7	Q96M32	723 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.28	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	ERICH2	A1L162	156 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	MCM5	P33992	734 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.27	□□□□□ -0.28
BECN1-222	ENST00000617806	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	PSME1	Q06323	249 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.27	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	ADCY5	O95622	1261 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	ABCC11	Q96J66	1382 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	MCM10	Q7L590	875 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	AACS	Q86V21	672 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	NUCB1	Q02818	461 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	HMGXB3	Q12766	1538 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	RLBP1	P12271	317 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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