RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602848.5

PPFIA3-211, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PPFIA3, Length 1,638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3-211ENST00000602848 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
PPFIA3-211ENST00000602848 SLAIN2Q9P270 581 aa29.14■■■□□ 2.26
PPFIA3-211ENST00000602848 PRKAR2BP31323 418 aa29.13■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 AMPHP49418 695 aa29.13■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 NEUROD2Q15784 382 aa29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 FBXO41Q8TF61 875 aa29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 RTL1A6NKG5 1358 aa29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.11■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.09■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.09■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 IL16Q14005 1332 aa29.09■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 ARHGEF10O15013 1369 aa29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 SOX12O15370 315 aa29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 PIP4K2BP78356 416 aa29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.08■■■□□ 2.25
PPFIA3-211ENST00000602848 HMOX1P09601 288 aa29.07■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 RIPK4P57078 832 aa29.07■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.07■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 NFAT5O94916 1531 aa29.07■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 NFE2L2Q16236 605 aa29.06■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.06■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 SLIT3O75094 1523 aa29.06■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 HOXC9P31274 260 aa29.05■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 USP19O94966 1318 aa29.05■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 BRINP3Q76B58 766 aa29.03■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.02■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 IP6K1Q92551 441 aa29.02■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.02■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.02■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 ALS2Q96Q42 1657 aa29.01■■■□□ 2.24
PPFIA3-211ENST00000602848 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.99■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 GCP02774 474 aa28.99■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.99■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 KDRP35968 1356 aa28.99■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 LTN1O94822 1766 aa28.98■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.97■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 PXDNQ92626 1479 aa28.95■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.95■■■□□ 2.23
PPFIA3-211ENST00000602848 EYA1Q99502 592 aa28.94■■■□□ 2.22
PPFIA3-211ENST00000602848 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PPFIA3-211ENST00000602848 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.94■■■□□ 2.22
PPFIA3-211ENST00000602848 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.94■■■□□ 2.22
PPFIA3-211ENST00000602848 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.93■■■□□ 2.22
PPFIA3-211ENST00000602848 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PPFIA3-211ENST00000602848 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.91■■■□□ 2.22
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PPFIA3-211ENST00000602848 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
PPFIA3-211ENST00000602848 PHLPP1O60346 1717 aa28.89■■■□□ 2.21
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PPFIA3-211ENST00000602848 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3-211ENST00000602848 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3-211ENST00000602848 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3-211ENST00000602848 GNAI1P63096 354 aa28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3-211ENST00000602848 IFT57Q9NWB7 429 aa28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3-211ENST00000602848 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3-211ENST00000602848 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3-211ENST00000602848 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.85■■■□□ 2.21
PPFIA3-211ENST00000602848 ABCC6O95255 1503 aa28.83■■■□□ 2.21
PPFIA3-211ENST00000602848 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 ZNF853P0CG23 659 aa28.81■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 ZNF428Q96B54 188 aa28.8■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 CFAP44Q96MT7 982 aa28.8■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 NCAPD2Q15021 1401 aa28.78■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 CPDO75976 1380 aa28.77■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 PLIN1O60240 522 aa28.77■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.77■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.76■■■□□ 2.2
PPFIA3-211ENST00000602848 BCAR3O75815 825 aa28.76■■■□□ 2.19
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PPFIA3-211ENST00000602848 NBPF4Q96M43 638 aa28.76■■■□□ 2.19
PPFIA3-211ENST00000602848 PDE3AQ14432 1141 aa28.75■■■□□ 2.19
PPFIA3-211ENST00000602848 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.75■■■□□ 2.19
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PPFIA3-211ENST00000602848 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.72■■■□□ 2.19
PPFIA3-211ENST00000602848 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PPFIA3-211ENST00000602848 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PPFIA3-211ENST00000602848 FAM83GA6ND36 823 aa28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3-211ENST00000602848 COL18A1P39060 1754 aa28.7■■■□□ 2.19
PPFIA3-211ENST00000602848 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.7■■■□□ 2.19
PPFIA3-211ENST00000602848 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
PPFIA3-211ENST00000602848 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.69■■■□□ 2.18
PPFIA3-211ENST00000602848 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.69■■■□□ 2.18
PPFIA3-211ENST00000602848 MBIPQ9NS73 344 aa28.69■■■□□ 2.18
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