RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.32□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 CPDO75976 1380 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 COL18A1P39060 1754 aa11.31□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 BTAF1O14981 1849 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 APLP1P51693 650 aa11.3□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 KIF3CO14782 793 aa11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 CRB1P82279 1406 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.28□□□□□ -0.6
ZNF548-208ENST00000597576 GRIN3BO60391 1043 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 JMYQ8N9B5 988 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 RGPD5Q99666 1765 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 EVA1CP58658 441 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF827Q17R98 1081 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 TNS4Q8IZW8 715 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 PRAM1Q96QH2 718 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 DDB1Q16531 1140 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 USP19O94966 1318 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 ADGRB1O14514 1584 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.24□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.22□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 LY75O60449 1722 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 KLHL34Q8N239 644 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 AKT1S1Q96B36 256 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 KLRG1Q96E93 195 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 STAC3Q96MF2 364 aa11.21□□□□□ -0.61
ZNF548-208ENST00000597576 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 NUTM2GQ5VZR2 741 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.2□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 ABCC6O95255 1503 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 POLD1P28340 1107 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 QRICH2Q9H0J4 1663 aa11.19□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 PIK3C2AO00443 1686 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 SLIT3O75094 1523 aa11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 TOMM70O94826 608 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 TNS2Q63HR2 1409 aa11.17□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 HTRA3P83110 453 aa11.16□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.16□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 GCP02774 474 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 RGL3Q3MIN7 710 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.15□□□□□ -0.62
ZNF548-208ENST00000597576 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 ADRA2BP18089 450 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 POGKQ9P215 609 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 USP6P35125 1406 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 TONSLQ96HA7 1378 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 USP54Q70EL1 1684 aa11.14□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 NEUROD1Q13562 356 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 ACEP12821 1306 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 ABTB2Q8N961 1025 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.1□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.09□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa11.09□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 C5P01031 1676 aa11.09□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.09□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.09□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.09□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.09□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.09□□□□□ -0.63
ZNF548-208ENST00000597576 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.08□□□□□ -0.64
ZNF548-208ENST00000597576 EXOC5O00471 708 aa11.08□□□□□ -0.64
ZNF548-208ENST00000597576 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.08□□□□□ -0.64
ZNF548-208ENST00000597576 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms