RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPN5P54829 565 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 CPS1P31327 1500 aa8.46□□□□□ -1.05
CAPNS1-208ENST00000589162 PSEN2P49810 448 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 TESK2Q96S53 571 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 POGKQ9P215 609 aa8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 TULP4Q9NRJ4 1543 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 NUTM2FA1L443 756 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCC11Q96J66 1382 aa8.45□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 DLC1Q96QB1 1528 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 NWD1Q149M9 1564 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 LAPTM4AQ15012 233 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 TECPR2O15040 1411 aa8.44□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.43□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 MFRPQ9BY79 579 aa8.43□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.43□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC7Q96M83 1385 aa8.43□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 STK24Q9Y6E0 443 aa8.42□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 PTCH1Q13635 1447 aa8.41□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.41□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 PIK3R4Q99570 1358 aa8.41□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.41□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZNB5 142 aa8.41□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 MYOM1P52179 1685 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM94Q12767 1356 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 TMF1P82094 1093 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 C14orf37Q86TY3 774 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK19Q9BWU1 502 aa8.4□□□□□ -1.06
CAPNS1-208ENST00000589162 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 USP32Q8NFA0 1604 aa8.4□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNK17Q96T54 332 aa8.39□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRB2O60241 1585 aa8.38□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.37□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.37□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 EVC2Q86UK5 1308 aa8.37□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXK1P85037 733 aa8.37□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 TMC1Q8TDI8 760 aa8.37□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 WNT2BQ93097 391 aa8.37□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 SIRT1Q96EB6 747 aa8.37□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.37□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP7BP35670 1465 aa8.36□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 STK25O00506 426 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF3Q9H094 633 aa8.35□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 ORAI2Q96SN7 254 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 PANK3Q9H999 370 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 CABP1Q9NZU7 370 aa8.34□□□□□ -1.07
CAPNS1-208ENST00000589162 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 SOCS7O14512 581 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.33□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 MST1RQ04912 1400 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPREP23469 700 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 PLPP6Q8IY26 295 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PP64 1363 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 MSH6P52701 1360 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 ITSN1Q15811 1721 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 ATF3P18847 181 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 ACEP12821 1306 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 AKAP12Q02952 1782 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 CDCA8Q53HL2 280 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-208ENST00000589162 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
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