RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570989.1

ITGA3-216, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

Gene ITGA3, Length 2,495 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-216ENST00000570989 SNX21Q969T3 373 aa18.21■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 CDK19Q9BWU1 502 aa18.2■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 TECPR2O15040 1411 aa18.19■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 SMC4Q9NTJ3 1288 aa18.18■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 CPS1P31327 1500 aa18.18■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.18■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 TERF2IPQ9NYB0 399 aa18.17■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.17■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.17■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.17■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 CFAP53Q96M91 514 aa18.17■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa18.16■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 FAM135BQ49AJ0 1406 aa18.16■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.16■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 KIF2CQ99661 725 aa18.16■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.15■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.15■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.15■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 LTKP29376 864 aa18.14■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 NUCB1Q02818 461 aa18.14■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.14■□□□□ 0.5
ITGA3-216ENST00000570989 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.14■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 CABP1Q9NZU7 370 aa18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 MED14O60244 1454 aa18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 ATP7BP35670 1465 aa18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 SLIT1O75093 1534 aa18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.12■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.12■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 KIF20BQ96Q89 1820 aa18.12■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 GBP4Q96PP9 640 aa18.12■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 SIRT1Q96EB6 747 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 GGNBP2Q9H3C7 697 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 WASLO00401 505 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 LNPKQ9C0E8 428 aa18.11■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 FYB1O15117 783 aa18.1■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.1■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.09■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.08■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 EID1Q9Y6B2 187 aa18.08■□□□□ 0.49
ITGA3-216ENST00000570989 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.07■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 IL16Q14005 1332 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 TPM2P07951 284 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 SSFA2P28290 1259 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 KIF16BQ96L93 1317 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 PTMSP20962 102 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 PTPRUQ92729 1446 aa18.05■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 CLEC17AQ6ZS10 378 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.04■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.03■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.03■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 AK9Q5TCS8 1911 aa18.02■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 CCDC61Q9Y6R9 512 aa18.02■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 DIP2AQ14689 1571 aa18.02■□□□□ 0.48
ITGA3-216ENST00000570989 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 ITSN1Q15811 1721 aa18.01■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 AKAP12Q02952 1782 aa18.01■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 PRR36Q9H6K5 1346 aa18■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 KLHL40Q2TBA0 621 aa18■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 ZSCAN30Q86W11 494 aa18■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 TBX22Q9Y458 520 aa18■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa17.99■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 BAG4O95429 457 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 ALDH1L2Q3SY69 923 aa17.99■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 PTCH1Q13635 1447 aa17.99■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 RIPK4P57078 832 aa17.98■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 ANKRD45Q5TZF3 282 aa17.98■□□□□ 0.47
ITGA3-216ENST00000570989 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms