RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 BRINP3Q76B58 766 aa23.16■■□□□ 1.3
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GDE1-203ENST00000564172 NEFLP07196 543 aa23.15■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 AMPHP49418 695 aa23.15■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.15■■□□□ 1.3
GDE1-203ENST00000564172 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.14■■□□□ 1.3
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GDE1-203ENST00000564172 GOLGA2Q08379 1002 aa23.13■■□□□ 1.29
GDE1-203ENST00000564172 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.13■■□□□ 1.29
GDE1-203ENST00000564172 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.13■■□□□ 1.29
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GDE1-203ENST00000564172 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.12■■□□□ 1.29
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GDE1-203ENST00000564172 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
GDE1-203ENST00000564172 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.12■■□□□ 1.29
GDE1-203ENST00000564172 GCP02774 474 aa23.1■■□□□ 1.29
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GDE1-203ENST00000564172 PXDNQ92626 1479 aa23.08■■□□□ 1.28
GDE1-203ENST00000564172 SLFN5Q08AF3 891 aa23.08■■□□□ 1.28
GDE1-203ENST00000564172 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
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GDE1-203ENST00000564172 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.05■■□□□ 1.28
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GDE1-203ENST00000564172 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.04■■□□□ 1.28
GDE1-203ENST00000564172 E9PSI1 815 aa23.04■■□□□ 1.28
GDE1-203ENST00000564172 WDR63Q8IWG1 891 aa23.04■■□□□ 1.28
GDE1-203ENST00000564172 RIPK4P57078 832 aa23.03■■□□□ 1.28
GDE1-203ENST00000564172 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
GDE1-203ENST00000564172 IL27Q8NEV9 243 aa23.02■■□□□ 1.28
GDE1-203ENST00000564172 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.02■■□□□ 1.28
GDE1-203ENST00000564172 EYA1Q99502 592 aa23.02■■□□□ 1.28
GDE1-203ENST00000564172 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.02■■□□□ 1.27
GDE1-203ENST00000564172 ARHGEF10O15013 1369 aa23.01■■□□□ 1.27
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GDE1-203ENST00000564172 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23■■□□□ 1.27
GDE1-203ENST00000564172 RCAN3Q9UKA8 241 aa23■■□□□ 1.27
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GDE1-203ENST00000564172 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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GDE1-203ENST00000564172 IL16Q14005 1332 aa22.91■■□□□ 1.26
GDE1-203ENST00000564172 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.91■■□□□ 1.26
GDE1-203ENST00000564172 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.9■■□□□ 1.26
GDE1-203ENST00000564172 NBPF4Q96M43 638 aa22.9■■□□□ 1.26
GDE1-203ENST00000564172 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.9■■□□□ 1.26
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GDE1-203ENST00000564172 DCTN1Q14203 1278 aa22.83■■□□□ 1.25
GDE1-203ENST00000564172 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.83■■□□□ 1.25
GDE1-203ENST00000564172 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 COL18A1P39060 1754 aa22.81■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 NCAPD2Q15021 1401 aa22.81■■□□□ 1.24
GDE1-203ENST00000564172 TOM1O60784 492 aa22.8■■□□□ 1.24
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