RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 AMPHP49418 695 aa23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTL1A6NKG5 1358 aa23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 HMOX1P09601 288 aa23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC27Q2M243 656 aa23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOXC9P31274 260 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCP02774 474 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRKAR2BP31323 418 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 E9PSI1 815 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 LTN1O94822 1766 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGEF10O15013 1369 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEFMP07197 916 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 IP6K1Q92551 441 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR63Q8IWG1 891 aa23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIPK4P57078 832 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLEKHG5O94827 1062 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 KDRP35968 1356 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-208ENST00000560962 EYA1Q99502 592 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-208ENST00000560962 NFE2L2Q16236 605 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLIN1O60240 522 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-208ENST00000560962 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL16Q14005 1332 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 CPDO75976 1380 aa23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCC6O95255 1503 aa23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
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USP3-AS1-208ENST00000560962 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.16■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.15■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF4Q96M43 638 aa23.15■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.15■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL18A1P39060 1754 aa23.14■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCAPD2Q15021 1401 aa23.14■■□□□ 1.3
USP3-AS1-208ENST00000560962 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCAR3O75815 825 aa23.13■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIAA0232Q92628 1395 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERBB3P21860 1342 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.12■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCA3Q99758 1704 aa23.11■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM83GA6ND36 823 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGPD5Q99666 1765 aa23.1■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 TOM1O60784 492 aa23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.09■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCTN1Q14203 1278 aa23.08■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.08■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.08■■□□□ 1.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHRNA2Q15822 529 aa23.07■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFT57Q9NWB7 429 aa23.06■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRBNQ96SW2 442 aa23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF853P0CG23 659 aa23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.05■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNAI1P63096 354 aa23.04■■□□□ 1.28
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