RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	WIPF1	O43516	503 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	FCHSD2	O94868	740 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	KDM5C	P41229	1560 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	RERE	Q9P2R6	1566 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	PLCH2	O75038	1416 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	OAT	P04181	439 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	FUT2	Q10981	343 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	EEA1	Q15075	1411 aa		7.52	□□□□□ -1.2
ATXN3-231	ENST00000554994	MROH2A	A6NES4	1674 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	MORN1	Q5T089	497 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	PRX	Q9BXM0	1461 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	SMPD1	P17405	629 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	THAP11	Q96EK4	314 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994		J3QL48	77 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	FECH	P22830	423 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP6V1A	P38606	617 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	NLRP7	Q8WX94	980 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	7.48	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	SYNM	O15061	1565 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	SENP2	Q9HC62	589 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	SAMD9	Q5K651	1589 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	WNT7A	O00755	349 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM47	Q96LD4	638 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	LRP6	O75581	1613 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATXN3-231	ENST00000554994	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	RXRB	P28702	533 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM32	Q13049	653 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	HPS1	Q92902	700 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	BRICD5	Q6PL45	260 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	ABCC1	P33527	1531 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	IQGAP1	P46940	1657 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	SEMA3E	O15041	775 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	GGT6	Q6P531	493 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	KIF14	Q15058	1648 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	TNR	Q92752	1358 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	GCGR	P47871	477 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	HIC1	Q14526	733 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	KIFC2	Q96AC6	838 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	JCAD	Q9P266	1359 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	RGS12	O14924	1447 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	MSS51	Q4VC12	460 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	MED14	O60244	1454 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	PHLPP1	O60346	1717 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-231	ENST00000554994	VEGFB	P49765	207 aa		7.4	□□□□□ -1.22

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