RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	33.85	■■■■□ 3.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	33.85	■■■■□ 3.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	HOXC9	P31274	260 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	PRKAR2B	P31323	418 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.82	■■■■□ 3.01
PPP1CC-208	ENST00000551676	GC	P02774	474 aa		33.81	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	HMOX1	P09601	288 aa		33.81	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		33.81	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	WDR63	Q8IWG1	891 aa		33.81	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	NEUROD2	Q15784	382 aa		33.8	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.8	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARHGEF10	O15013	1369 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676		E9PSI1	815 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	IP6K1	Q92551	441 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	NEFL	P07196	543 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	NEFM	P07197	916 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
PPP1CC-208	ENST00000551676	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	LTN1	O94822	1766 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	33.74	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	33.74	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	NFE2L2	Q16236	605 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	RIPK4	P57078	832 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	FKBP8	Q14318	412 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	KDR	P35968	1356 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	EYA1	Q99502	592 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP1CC-208	ENST00000551676	IL16	Q14005	1332 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PPP1CC-208	ENST00000551676	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PPP1CC-208	ENST00000551676	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PPP1CC-208	ENST00000551676	PLEKHG5	O94827	1062 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP1CC-208	ENST00000551676	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	CPD	O75976	1380 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	ABCC6	O95255	1503 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	NBPF4	Q96M43	638 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.96
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	COL18A1	P39060	1754 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	ERBB3	P21860	1342 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF853	P0CG23	659 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	IFT57	Q9NWB7	429 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM83G	A6ND36	823 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	GNAI1	P63096	354 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	RGPD5	Q99666	1765 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	ABCA3	Q99758	1704 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PPP1CC-208	ENST00000551676	DCTN1	Q14203	1278 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	CFAP44	Q96MT7	982 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	TOM1	O60784	492 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	MCM10	Q7L590	875 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	PLIN1	O60240	522 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	CRB1	P82279	1406 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PPP1CC-208	ENST00000551676	BCAR3	O75815	825 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92

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