RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551219.5

PTPRR-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRR, Length 2,966 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-211ENST00000551219 CD109Q6YHK3 1445 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 ITPRIPQ8IWB1 547 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 SEMA3EO15041 775 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 CLCN1P35523 988 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 DDIT3P35638 169 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 NUCB1Q02818 461 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 ASXL2Q76L83 1435 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 GBP4Q96PP9 640 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 A0A1W2PP64 1363 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 GCC1Q96CN9 775 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 WDR70Q9NW82 654 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 PIK3R4Q99570 1358 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 PTCH1Q13635 1447 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-211ENST00000551219 RIPK4P57078 832 aa8.34□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 FCHSD2O94868 740 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 CABP2Q9NPB3 220 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 PTPRMP28827 1452 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 STK25O00506 426 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 POLA2Q14181 598 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 PANK2Q9BZ23 570 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 FYB1O15117 783 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 GGT6Q6P531 493 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 LNPKQ9C0E8 428 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 ESPNB1AK53 854 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 NEO1Q92859 1461 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 ATP7BP35670 1465 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 ABCC4O15439 1325 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 CDC45O75419 566 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 KIF2CQ99661 725 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 IFT57Q9NWB7 429 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 GNAI1P63096 354 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 NFE2L2Q16236 605 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 DLC1Q96QB1 1528 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRR-211ENST00000551219 RABEP1Q15276 862 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms