RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRO-210ENST00000544244 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRO-210ENST00000544244 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRO-210ENST00000544244 ADGRB2O60241 1585 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRO-210ENST00000544244 A0A0G2JS52 829 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 ADAMTS2O95450 1211 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 MYT1Q01538 1121 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 POLKQ9UBT6 870 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 NEUROD2Q15784 382 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 STRCQ7RTU9 1775 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 STRN4Q9NRL3 753 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 FBLN1P23142 703 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 NGLY1Q96IV0 654 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 USP31Q70CQ4 1352 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 CHRNA2Q15822 529 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 IP6K1Q92551 441 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 FLT4P35916 1363 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 RUNDC1Q96C34 613 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 HMOX1P09601 288 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 ADAMTS8Q9UP79 889 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 NGEFQ8N5V2 710 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 POLA2Q14181 598 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 FCHSD2O94868 740 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 HOXC9P31274 260 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC184Q52MB2 194 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 ITSN1Q15811 1721 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 PRKAR2BP31323 418 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 NEFLP07196 543 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 USP35Q9P2H5 1018 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 JCADQ9P266 1359 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 KIF1AQ12756 1690 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 APAF1O14727 1248 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 C8orf37Q96NL8 207 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRO-210ENST00000544244 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 HSPA1LP34931 641 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 RTL1A6NKG5 1358 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 SPG7Q9UQ90 795 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 KIAA0232Q92628 1395 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 RIPK4P57078 832 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 BTG4Q9NY30 223 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 USP19O94966 1318 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 INSRP06213 1382 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 IL13P35225 146 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 EYA1Q99502 592 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 SSH2Q76I76 1423 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 PDE3BQ13370 1112 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 GOLGA2Q08379 1002 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 TEFQ10587 303 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 NFE2L2Q16236 605 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 FBXO41Q8TF61 875 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 FAM83GA6ND36 823 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRO-210ENST00000544244 EXOC5O00471 708 aa7.35□□□□□ -1.23
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